More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2318 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  100 
 
 
307 aa  624  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  44 
 
 
363 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  40.17 
 
 
417 aa  187  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  40.08 
 
 
412 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.59 
 
 
274 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  34.63 
 
 
430 aa  156  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  35.66 
 
 
283 aa  152  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  37.08 
 
 
271 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.73 
 
 
303 aa  143  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  34.15 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  34.89 
 
 
271 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  34.89 
 
 
271 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  34.84 
 
 
324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  34.02 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  33.47 
 
 
297 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  32.91 
 
 
265 aa  125  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  31.54 
 
 
295 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  34.71 
 
 
320 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  31.95 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  30.38 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  41.67 
 
 
445 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  46.9 
 
 
303 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.35 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  44.74 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  43.7 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  41.46 
 
 
446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  44.78 
 
 
569 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  30.4 
 
 
312 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  31.28 
 
 
376 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  40.65 
 
 
447 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  40.65 
 
 
447 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  29.75 
 
 
278 aa  112  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  31.05 
 
 
452 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  38.41 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  44.54 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  30.45 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  29.08 
 
 
582 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  43.7 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  41.38 
 
 
388 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  46.55 
 
 
524 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  29.18 
 
 
305 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  45.76 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  42.98 
 
 
247 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  43.86 
 
 
459 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  43.18 
 
 
533 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  41.22 
 
 
377 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  34.01 
 
 
310 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  30.62 
 
 
284 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.74 
 
 
309 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  45.53 
 
 
441 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  45.53 
 
 
431 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  42.15 
 
 
319 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  31.28 
 
 
315 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  39.19 
 
 
314 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  46.43 
 
 
387 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  35.23 
 
 
374 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  45 
 
 
318 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  41.67 
 
 
377 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  42.48 
 
 
300 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  41.46 
 
 
243 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  40.3 
 
 
440 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  47.86 
 
 
328 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  43.48 
 
 
430 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  43.33 
 
 
413 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  35.93 
 
 
282 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  44.03 
 
 
394 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0287  Peptidase M23  30.36 
 
 
297 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  43.41 
 
 
375 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  44.14 
 
 
288 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.44 
 
 
304 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  42.86 
 
 
305 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  45.22 
 
 
323 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  41.46 
 
 
238 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  42.86 
 
 
341 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  36 
 
 
301 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  42.5 
 
 
367 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  43.75 
 
 
402 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  47.2 
 
 
414 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  37.88 
 
 
293 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  43.7 
 
 
299 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  43.33 
 
 
482 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  47.27 
 
 
529 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  39.82 
 
 
605 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  37.86 
 
 
374 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  45.05 
 
 
400 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  41.38 
 
 
300 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  42.86 
 
 
305 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  29.58 
 
 
369 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  41.46 
 
 
439 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  42.5 
 
 
285 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  42.86 
 
 
299 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  29.58 
 
 
319 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  45.45 
 
 
523 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.13 
 
 
423 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.36 
 
 
399 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.36 
 
 
399 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  29.76 
 
 
402 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  45.54 
 
 
290 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  38.39 
 
 
610 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>