More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1077 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  100 
 
 		 507 aa  1034    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  39.36 
 
 		 550 aa  300  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  40.86 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  39.19 
 
 		 423 aa  249  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  41.61 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  38.29 
 
 		 431 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  38.29 
 
 		 431 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  38.29 
 
 		 431 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  40.24 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  38.26 
 
 		 433 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  38.26 
 
 		 433 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  38.26 
 
 		 433 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  39.12 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  38.26 
 
 		 433 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  38.84 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  38.23 
 
 		 438 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  36.97 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  35.61 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  37.3 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  37.65 
 
 		 439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  36.05 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  37.46 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  34.73 
 
 		 439 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  34.73 
 
 		 439 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  36.66 
 
 		 404 aa  213  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  34.73 
 
 		 439 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  34.73 
 
 		 439 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  34.73 
 
 		 439 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  34.77 
 
 		 419 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  34.77 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  34.77 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  34.77 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  34.77 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  34.77 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  34.77 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  34.67 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  34.77 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  37.54 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  34.77 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  35.05 
 
 		 482 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  35.94 
 
 		 441 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  35.08 
 
 		 438 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  35.08 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  35.08 
 
 		 438 aa  210  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  36.1 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  36.03 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  39.87 
 
 		 458 aa  202  9e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  34.3 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  32.77 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  34.07 
 
 		 460 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  33.7 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  38.27 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  33.89 
 
 		 491 aa  186  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  34.88 
 
 		 466 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  32.4 
 
 		 436 aa  186  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  34.88 
 
 		 491 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  33.33 
 
 		 472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  33.25 
 
 		 513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  35.19 
 
 		 482 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  35 
 
 		 512 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  34.26 
 
 		 466 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  34.57 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  32.53 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  33.24 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  34.26 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  34.26 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.57 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  31.75 
 
 		 439 aa  179  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  31.89 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  32.92 
 
 		 475 aa  176  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  33.64 
 
 		 468 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  31.05 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  31.49 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  29.86 
 
 		 441 aa  170  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  29.63 
 
 		 447 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  32.62 
 
 		 353 aa  169  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  28.49 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  31.25 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  28.49 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  31.25 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  30.14 
 
 		 474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  30.33 
 
 		 475 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  30.71 
 
 		 472 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  30.43 
 
 		 473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  29.82 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  30.14 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  31.14 
 
 		 470 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  30.54 
 
 		 459 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  31.44 
 
 		 479 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  31.34 
 
 		 517 aa  156  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  31.22 
 
 		 490 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  32.49 
 
 		 448 aa  154  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  29.01 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  28.81 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  30.79 
 
 		 472 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  32.72 
 
 		 741 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  29.81 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  37.14 
 
 		 328 aa  140  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  30.92 
 
 		 569 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>