More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5984 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  100 
 
 
284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.38 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  44.31 
 
 
352 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  42.44 
 
 
288 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  51.69 
 
 
452 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  53.47 
 
 
491 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.2 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  48.84 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.19 
 
 
235 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  45.45 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  48.33 
 
 
446 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  44.85 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  48.33 
 
 
447 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  48.33 
 
 
447 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  50.39 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  44.44 
 
 
430 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  54.03 
 
 
411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  49.21 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  41.03 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  40.7 
 
 
311 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  38.2 
 
 
398 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  41.38 
 
 
453 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.16 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  47.32 
 
 
455 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  41.67 
 
 
339 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  44.8 
 
 
446 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  41.03 
 
 
339 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.2 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.73 
 
 
274 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  46.77 
 
 
243 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.03 
 
 
442 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  45.16 
 
 
238 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  43.36 
 
 
383 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  44.96 
 
 
462 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  50 
 
 
387 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  39.53 
 
 
224 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  46.72 
 
 
198 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  41.28 
 
 
448 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  42.86 
 
 
282 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  50 
 
 
524 aa  105  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  42.86 
 
 
360 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  42.86 
 
 
360 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  42.86 
 
 
360 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  45.9 
 
 
198 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  39.02 
 
 
238 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  44.53 
 
 
334 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  46.88 
 
 
458 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  48.51 
 
 
456 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  38.51 
 
 
412 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  51.02 
 
 
460 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.14 
 
 
312 aa  104  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  43.94 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  45.11 
 
 
457 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  46.73 
 
 
459 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  43.09 
 
 
406 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  40.58 
 
 
441 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  44.09 
 
 
431 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  41.57 
 
 
270 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  43.94 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  39.33 
 
 
453 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  48.51 
 
 
404 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  46.73 
 
 
457 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  38.2 
 
 
454 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  39.86 
 
 
455 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.7 
 
 
328 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  47.15 
 
 
538 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  44.12 
 
 
468 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  42.67 
 
 
253 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  46.72 
 
 
465 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  38.2 
 
 
454 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  49.07 
 
 
482 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  45.9 
 
 
582 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  40.74 
 
 
430 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  44.96 
 
 
358 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  43.75 
 
 
419 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40.69 
 
 
454 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  46.72 
 
 
727 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  37.84 
 
 
233 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  46.72 
 
 
727 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  43.51 
 
 
332 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  43.51 
 
 
465 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  50.49 
 
 
287 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  49.06 
 
 
683 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  43.8 
 
 
367 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  40.91 
 
 
272 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  46.72 
 
 
751 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  47.54 
 
 
824 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  36.32 
 
 
231 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  40.65 
 
 
237 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  36.22 
 
 
300 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  45.53 
 
 
460 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  43.38 
 
 
265 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  47.2 
 
 
402 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  43.44 
 
 
443 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  40.82 
 
 
352 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  50 
 
 
404 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  47.9 
 
 
615 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  50.47 
 
 
376 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  42.19 
 
 
375 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.12 
 
 
248 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>