More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1800 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  100 
 
 		 412 aa  806    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  52.03 
 
 		 427 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  52.03 
 
 		 427 aa  259  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  39.61 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  47.94 
 
 		 534 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  47.73 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  42.24 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  48.28 
 
 		 509 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  42.91 
 
 		 538 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  43.4 
 
 		 484 aa  183  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  39.19 
 
 		 447 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  41.38 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  41.83 
 
 		 478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  62.5 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  60 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  61.67 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  49.47 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  50.66 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  57.98 
 
 		 501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  58.82 
 
 		 494 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  56.3 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  57.98 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  57.98 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  57.98 
 
 		 455 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  36.07 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  35.78 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  40 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  35.66 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.65 
 
 		 509 aa  143  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  50.39 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  34.83 
 
 		 311 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  34.83 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  37.83 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  36.09 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  53.33 
 
 		 294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  53.33 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  52.5 
 
 		 292 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  31.29 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  31.32 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  31.38 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0370  peptidase M23B  31.71 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  33.96 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  36.19 
 
 		 261 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  31.54 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  35.04 
 
 		 252 aa  124  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  31.54 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  31.54 
 
 		 377 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  31.54 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  31.54 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  35.56 
 
 		 270 aa  123  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  33.09 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  33.09 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  33.09 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  33.09 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  33.09 
 
 		 363 aa  123  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  33.09 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  36.74 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  46.97 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  46.97 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  31.02 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  31.34 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  49.15 
 
 		 198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  36.23 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  30.5 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  48.31 
 
 		 198 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  36.84 
 
 		 284 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  36.5 
 
 		 287 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  30.71 
 
 		 285 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  34.59 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  32.11 
 
 		 590 aa  119  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  32.58 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  30.65 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  34.09 
 
 		 268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.14 
 
 		 274 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  30 
 
 		 279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  30.66 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  31.64 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  47.86 
 
 		 292 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  34.19 
 
 		 230 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  31.39 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  31.39 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  31.39 
 
 		 363 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  48.36 
 
 		 285 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  47.01 
 
 		 296 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  47.01 
 
 		 296 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  31.2 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  31.2 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  47.01 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  31.2 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  31.2 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  47.01 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  47.01 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  47.01 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  32.97 
 
 		 633 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  47.01 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  47.01 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  48.74 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  47.01 
 
 		 292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  31.2 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  32.85 
 
 		 289 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>