More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0929 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  100 
 
 		 261 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  46.21 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  50.21 
 
 		 262 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  50.21 
 
 		 262 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  50.41 
 
 		 293 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  50 
 
 		 284 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  48.31 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  45.96 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  48.94 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  42.29 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  43.84 
 
 		 285 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  48.51 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  47.26 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  47.37 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  45.53 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  42.11 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  44.44 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  41.92 
 
 		 377 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  41.92 
 
 		 377 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  41.92 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  41.92 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  41.92 
 
 		 377 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  41.85 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  39.8 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  42.86 
 
 		 374 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  42.53 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  44.64 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  42.15 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  41.9 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.23 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  42.4 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  41.63 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  38.54 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  41.6 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  41.6 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  41.6 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  41.6 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  40 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  41.6 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  41.6 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  43.04 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  44 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  38.6 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  39.23 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  39.23 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  40.93 
 
 		 327 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  39.66 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  40.53 
 
 		 379 aa  178  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  40.53 
 
 		 379 aa  178  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  40.53 
 
 		 363 aa  178  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  45.19 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  39.04 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  44.44 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  39.04 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  44.3 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  39.85 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  44.44 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  40.4 
 
 		 315 aa  174  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  38.83 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  40.64 
 
 		 298 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  45.92 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  43.89 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  41.02 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  40.82 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  45.92 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  41.47 
 
 		 345 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  45.92 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  45.92 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  45.92 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  45.92 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  40 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  38.87 
 
 		 294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  45.92 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  45.3 
 
 		 292 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  41.04 
 
 		 298 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  38.65 
 
 		 298 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  38.65 
 
 		 298 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  40.24 
 
 		 304 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  44.49 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  43.35 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  39.26 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  45.45 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  43.35 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  40.55 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  40.55 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  40.55 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  40.55 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  33 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  39.33 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  42.39 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  43.88 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  43.18 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  40.55 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  40.08 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  39.85 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  44.3 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  46.55 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  40.66 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  41.1 
 
 		 323 aa  165  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  44.35 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>