More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1732 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  100 
 
 
295 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  98.64 
 
 
295 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  89.86 
 
 
296 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  93.24 
 
 
296 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  93.24 
 
 
296 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  91.53 
 
 
294 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  89.15 
 
 
292 aa  474  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  73.82 
 
 
312 aa  417  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  70.79 
 
 
315 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  72.61 
 
 
311 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  73.55 
 
 
298 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  73.38 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  73.38 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  73.38 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  73.38 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  73.38 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  73.03 
 
 
292 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  75.09 
 
 
292 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  51.65 
 
 
292 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  54.89 
 
 
301 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  55.84 
 
 
318 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  52.65 
 
 
287 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  50.5 
 
 
299 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  55.09 
 
 
295 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  53.91 
 
 
275 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  49.68 
 
 
298 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  51.17 
 
 
274 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  50.69 
 
 
303 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  52.34 
 
 
268 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  46.53 
 
 
304 aa  245  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  48.2 
 
 
295 aa  244  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  52.25 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  52.26 
 
 
317 aa  242  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  52.81 
 
 
238 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  48.96 
 
 
315 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  51.53 
 
 
230 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  48.59 
 
 
240 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  51.95 
 
 
236 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  43.96 
 
 
270 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  49.78 
 
 
236 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.92 
 
 
233 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  48.92 
 
 
233 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.92 
 
 
233 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.92 
 
 
233 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  45.36 
 
 
252 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  48.92 
 
 
296 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.92 
 
 
296 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  50.66 
 
 
230 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  49.12 
 
 
295 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  51.97 
 
 
233 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  47.31 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  51.53 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  51.53 
 
 
233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  46.93 
 
 
264 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  51.09 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  50.22 
 
 
239 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  44.57 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  43.07 
 
 
262 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  43.07 
 
 
262 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  46.05 
 
 
274 aa  195  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  40.91 
 
 
285 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  43.62 
 
 
297 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  42.11 
 
 
288 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  39.94 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  46.46 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  42.31 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  45.65 
 
 
261 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  42.96 
 
 
230 aa  189  7e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  42.96 
 
 
230 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  44.78 
 
 
284 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.8 
 
 
288 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  40.62 
 
 
293 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  40.28 
 
 
285 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  39.78 
 
 
261 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  41.97 
 
 
289 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  41.97 
 
 
289 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  69.17 
 
 
303 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  45.92 
 
 
286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  38.48 
 
 
360 aa  182  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  41.01 
 
 
248 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  40.07 
 
 
256 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.41 
 
 
322 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  40.41 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.41 
 
 
322 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.41 
 
 
322 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.41 
 
 
322 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  37.09 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  38.76 
 
 
325 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.41 
 
 
322 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  41.15 
 
 
384 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  45.49 
 
 
267 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  40.41 
 
 
315 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  38.65 
 
 
289 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  35.38 
 
 
327 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  35.76 
 
 
311 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1654  lipoprotein NlpD, putative  71.05 
 
 
186 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  38.31 
 
 
310 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  42.73 
 
 
279 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  35.38 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  35.38 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>