More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4989 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  68.52 
 
 		 262 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  44.4 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  48.87 
 
 		 261 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  46.22 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  47.49 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  45.21 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  45.21 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  45.21 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  45.62 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  47.42 
 
 		 243 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  47.42 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  45.33 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  37.81 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  45.33 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  43.81 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  45.58 
 
 		 296 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  45.58 
 
 		 296 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  43.75 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  41.95 
 
 		 298 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0423  putative lipoprotein NlpD  44.59 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.897746  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  41.95 
 
 		 292 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0472  putative lipoprotein NlpD  44.59 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2512  putative peptidase  44.59 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1801  putative lipoprotein NlpD  44.59 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  41.95 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0825  peptidase  45.45 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2373  putative peptidase  45.45 
 
 		 343 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  41.95 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  45.32 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  41.95 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  41.95 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  41.95 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.15 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  45.15 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.15 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  45.15 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.15 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  44.98 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.15 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  43.95 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  40.42 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  41.1 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  44.5 
 
 		 236 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  39.51 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  38.46 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  42.65 
 
 		 230 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.35 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  42.47 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  39.36 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  39.36 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  42.72 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  39.53 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0634  lipoprotein NlpD, putative  43.29 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0768696  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  42.72 
 
 		 240 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  42.73 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  42.33 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  40.65 
 
 		 279 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  36.18 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  39.72 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  41.26 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  39.03 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  36.68 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  41.4 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  39.04 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  40.81 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  42.79 
 
 		 238 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.98 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  38.98 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.98 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.98 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  35.95 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.98 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  36.48 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  43.6 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  37.55 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.98 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  39.6 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  40.18 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  38.98 
 
 		 315 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  41.83 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  40.47 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  35.58 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  39.42 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  40.77 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  38.6 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  42.65 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  37.04 
 
 		 325 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  33.98 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  35.79 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  43.06 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  43.54 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  43.06 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  43.06 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  37.79 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1995  lipoprotein  38.5 
 
 		 242 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  35.66 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  53.78 
 
 		 384 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  32.69 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  39.17 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>