More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1451 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  100 
 
 
384 aa  765    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  83.13 
 
 
322 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  82.83 
 
 
322 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  83.13 
 
 
322 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  83.13 
 
 
322 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  83.13 
 
 
322 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  82.77 
 
 
315 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  82.15 
 
 
315 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  52.74 
 
 
289 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  52.74 
 
 
289 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  53.4 
 
 
279 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  52.96 
 
 
286 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  52.96 
 
 
279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  53.27 
 
 
284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  49.84 
 
 
289 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  52.45 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  43.15 
 
 
331 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  55.28 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  43.09 
 
 
312 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  44.18 
 
 
315 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  43.15 
 
 
311 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  41.63 
 
 
296 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  42.45 
 
 
295 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  42.86 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  42.86 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  36.28 
 
 
304 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  35.53 
 
 
292 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  41.22 
 
 
295 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  44.49 
 
 
292 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  42.45 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  42.45 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  42.45 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  42.45 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  42.45 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  42.45 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  42.45 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  41.46 
 
 
294 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  37.96 
 
 
301 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  34.81 
 
 
270 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  38.94 
 
 
318 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.25 
 
 
287 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  39.38 
 
 
295 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  39.6 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  39.63 
 
 
317 aa  166  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  40.23 
 
 
230 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  40.23 
 
 
230 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  34.69 
 
 
298 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  40.32 
 
 
233 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  36.73 
 
 
275 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.32 
 
 
233 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.32 
 
 
233 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.32 
 
 
233 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  35.51 
 
 
295 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  36.09 
 
 
252 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  37.55 
 
 
268 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  40.32 
 
 
296 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  36.36 
 
 
248 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.32 
 
 
296 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  37.14 
 
 
274 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  37.14 
 
 
262 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  57.63 
 
 
292 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  38.29 
 
 
292 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  39.52 
 
 
240 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  37.14 
 
 
261 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  38.31 
 
 
238 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  36.4 
 
 
236 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  35.92 
 
 
293 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  31.79 
 
 
360 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  36.84 
 
 
264 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  35.43 
 
 
274 aa  149  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  33.01 
 
 
256 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  38.04 
 
 
309 aa  146  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  35.89 
 
 
295 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  32.81 
 
 
261 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  53.28 
 
 
299 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  32.79 
 
 
290 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  37.4 
 
 
284 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  40.32 
 
 
233 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  37.35 
 
 
267 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  41.13 
 
 
233 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  41.13 
 
 
233 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  30.98 
 
 
283 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  40.73 
 
 
233 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  36.14 
 
 
261 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  39.11 
 
 
239 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  34.39 
 
 
257 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  32 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  35.89 
 
 
236 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  33.04 
 
 
297 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  29.56 
 
 
298 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  32.92 
 
 
367 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  50.82 
 
 
303 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  50.82 
 
 
303 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  30.68 
 
 
311 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  34.46 
 
 
377 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  34.11 
 
 
377 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  34.11 
 
 
377 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  34.11 
 
 
377 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  34.11 
 
 
377 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  35.46 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>