More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2632 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  100 
 
 
367 aa  728    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  38.46 
 
 
377 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  38.46 
 
 
377 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  38.46 
 
 
377 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  38.46 
 
 
377 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  38.15 
 
 
377 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  36.52 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  37.85 
 
 
374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  37.98 
 
 
401 aa  182  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  33.7 
 
 
309 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  31.17 
 
 
311 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  30.7 
 
 
296 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  34.04 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  47.59 
 
 
293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  41.08 
 
 
283 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  59.17 
 
 
284 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  55.65 
 
 
333 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  56.67 
 
 
297 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  57.5 
 
 
262 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  57.5 
 
 
262 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  57.5 
 
 
285 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  55.37 
 
 
345 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  57.5 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  57.5 
 
 
285 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  57.5 
 
 
288 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  57.94 
 
 
309 aa  151  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  57.26 
 
 
318 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  55.12 
 
 
261 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  54.55 
 
 
344 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  54.84 
 
 
301 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  56.67 
 
 
379 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  58.87 
 
 
292 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  56.67 
 
 
363 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  56.67 
 
 
379 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  56.67 
 
 
379 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  56.67 
 
 
379 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  56.67 
 
 
379 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  56.67 
 
 
379 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  55 
 
 
327 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  54.17 
 
 
328 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  55 
 
 
293 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  56.67 
 
 
379 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  56.67 
 
 
363 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  55 
 
 
327 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  55 
 
 
327 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  57.26 
 
 
292 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  57.26 
 
 
295 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  58.82 
 
 
289 aa  149  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  46.77 
 
 
230 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  56.2 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  56.2 
 
 
315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  57.26 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  56.91 
 
 
265 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  56.2 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  54.55 
 
 
290 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  56.45 
 
 
298 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  56.45 
 
 
315 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  56.67 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  54.24 
 
 
307 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  55.37 
 
 
311 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  56.45 
 
 
303 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  56.45 
 
 
303 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  50.83 
 
 
285 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  55 
 
 
295 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  56.69 
 
 
230 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  55 
 
 
295 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  56.52 
 
 
307 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  30.25 
 
 
298 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  53.39 
 
 
307 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  50 
 
 
296 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  47.55 
 
 
257 aa  143  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  51.59 
 
 
272 aa  143  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  55.37 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  55 
 
 
296 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  55 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  55 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  52.85 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  51.67 
 
 
249 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  55.37 
 
 
296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  55.37 
 
 
292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  55.37 
 
 
296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  55.37 
 
 
296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  55.37 
 
 
296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  55.37 
 
 
296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  52.76 
 
 
261 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  55.37 
 
 
292 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  54.17 
 
 
294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  55 
 
 
274 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  49.15 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  50.83 
 
 
298 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  50.83 
 
 
298 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  50.83 
 
 
298 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  50.83 
 
 
298 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  49.19 
 
 
304 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  48.84 
 
 
250 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  48.84 
 
 
250 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  53.23 
 
 
304 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  40.36 
 
 
298 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  48.84 
 
 
250 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  50 
 
 
230 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>