More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0497 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  100 
 
 		 360 aa  733    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.43 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  40.7 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  44.14 
 
 		 309 aa  193  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  44.16 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  39.3 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  36.53 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  38.86 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  38.35 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  38.92 
 
 		 262 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  38.24 
 
 		 262 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  37.15 
 
 		 257 aa  173  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  40.38 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  40.14 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  39.78 
 
 		 327 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  36.92 
 
 		 345 aa  171  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  39.78 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  35.74 
 
 		 307 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  37.81 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2507  lipoprotein  36.12 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  36.25 
 
 		 289 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  40.35 
 
 		 311 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  38.49 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  38.21 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  38.89 
 
 		 377 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  38.18 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  36.47 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  68.75 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  38.89 
 
 		 377 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  39.93 
 
 		 274 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  38.89 
 
 		 377 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  38.89 
 
 		 377 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  38.89 
 
 		 377 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  37.32 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  33.03 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  33.03 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  33.44 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  33.33 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  37.14 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  33.33 
 
 		 298 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  65.52 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  66.96 
 
 		 252 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  37.99 
 
 		 379 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  37.99 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  37.99 
 
 		 379 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  37.99 
 
 		 379 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  37.99 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  37.99 
 
 		 379 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  33.33 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  37.99 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  37.99 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  37.99 
 
 		 379 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  39.86 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  33.85 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  63.79 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  63.79 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  58.02 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  63.79 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  63.79 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  65.52 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  35.09 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  62.93 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  58.09 
 
 		 260 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  59.09 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  62.93 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  55.8 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  55.56 
 
 		 288 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  60.33 
 
 		 298 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  60.33 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  60.33 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  60.33 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  60.33 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  64.1 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  60.33 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  60.33 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  62.07 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  37.32 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  61.54 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  62.07 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  62.93 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  37.41 
 
 		 296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  62.71 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  49.43 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  59.84 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  61.21 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  63.16 
 
 		 274 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  35.45 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  61.02 
 
 		 293 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  46.41 
 
 		 230 aa  150  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  46.41 
 
 		 230 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  61.54 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  61.54 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  34.42 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  62.28 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  62.28 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  32.93 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  33.02 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  33.85 
 
 		 265 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  33.7 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  33.7 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>