More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1416 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  100 
 
 
299 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  73.44 
 
 
303 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  68.98 
 
 
292 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  73.44 
 
 
303 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  62.66 
 
 
295 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  64.54 
 
 
301 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  65.73 
 
 
318 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  64 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  61.95 
 
 
292 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  58.96 
 
 
317 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  57.81 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  50.17 
 
 
295 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  49.84 
 
 
315 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  49.68 
 
 
311 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  50.33 
 
 
296 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  50.67 
 
 
296 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  50.67 
 
 
296 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  50.49 
 
 
312 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  47.71 
 
 
304 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  51.75 
 
 
294 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  51.17 
 
 
295 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  50.7 
 
 
292 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  57.87 
 
 
287 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  57.26 
 
 
295 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  50.87 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  50.87 
 
 
298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  50.87 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  50.87 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  50.87 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  50.87 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  50.87 
 
 
292 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  50.18 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  50 
 
 
275 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  53.22 
 
 
230 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  51.29 
 
 
268 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  49.26 
 
 
274 aa  221  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  43.48 
 
 
270 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  52.59 
 
 
236 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  52.59 
 
 
230 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  50.43 
 
 
274 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  52.16 
 
 
238 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  49.57 
 
 
236 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  50.43 
 
 
233 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  50.43 
 
 
296 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.43 
 
 
233 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.43 
 
 
233 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.43 
 
 
233 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.43 
 
 
296 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  48.95 
 
 
240 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  42.72 
 
 
252 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  49.14 
 
 
295 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  45.45 
 
 
285 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  50.6 
 
 
297 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  48.74 
 
 
293 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  47.46 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  47.99 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  51.29 
 
 
233 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  39.02 
 
 
333 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  43.1 
 
 
290 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  50.86 
 
 
233 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  50.86 
 
 
233 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  53.02 
 
 
239 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  49.57 
 
 
233 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  46.35 
 
 
288 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  48.07 
 
 
288 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  39.93 
 
 
297 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  47.06 
 
 
285 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  42.02 
 
 
379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  42.02 
 
 
363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  51.49 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  45.34 
 
 
257 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  42.02 
 
 
379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  42.02 
 
 
379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  42.02 
 
 
379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  44.76 
 
 
284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  42.02 
 
 
379 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.64 
 
 
322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  39.87 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  42.41 
 
 
377 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  43.19 
 
 
377 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  43.19 
 
 
377 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  42.8 
 
 
377 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  43.19 
 
 
377 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  39.53 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  44.73 
 
 
293 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  39.87 
 
 
327 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  39.87 
 
 
327 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  45.73 
 
 
264 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.31 
 
 
322 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.31 
 
 
322 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.31 
 
 
322 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  38.31 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  41.86 
 
 
374 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  39.67 
 
 
289 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  35.8 
 
 
328 aa  178  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.31 
 
 
322 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  39.67 
 
 
289 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  38.31 
 
 
315 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  39.3 
 
 
379 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  39.3 
 
 
379 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>