More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1542 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 		 296 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  100 
 
 		 296 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  98.31 
 
 		 236 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  91.85 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  76.82 
 
 		 230 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  78.54 
 
 		 239 aa  337  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  77.25 
 
 		 230 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  72.53 
 
 		 238 aa  331  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  67.89 
 
 		 240 aa  329  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  73.16 
 
 		 236 aa  325  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  72.96 
 
 		 233 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  72.53 
 
 		 233 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  72.53 
 
 		 233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  72.53 
 
 		 233 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  45.05 
 
 		 295 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  45.45 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  45.62 
 
 		 296 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  45.62 
 
 		 296 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  45.42 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  47.73 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  48.7 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  45.22 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  48.91 
 
 		 298 aa  211  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  44.81 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  45.87 
 
 		 312 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  47.23 
 
 		 318 aa  208  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  40.61 
 
 		 311 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  47.84 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  47.86 
 
 		 292 aa  205  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  48.47 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  40.94 
 
 		 315 aa  204  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  48.47 
 
 		 296 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  48.47 
 
 		 296 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  48.47 
 
 		 296 aa  204  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  48.47 
 
 		 296 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  48.47 
 
 		 296 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  48.47 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  42.75 
 
 		 304 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  48.17 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  41.69 
 
 		 295 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  47.73 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  45.11 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.37 
 
 		 287 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  48.13 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  48.65 
 
 		 275 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  48.87 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  44.58 
 
 		 315 aa  188  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  41.41 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  43.25 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  46.51 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  46.05 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  45.69 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  45.69 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  45.69 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  46.05 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  44.83 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  46.05 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  45.69 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  45.69 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  47.17 
 
 		 250 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  46.67 
 
 		 279 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  43.86 
 
 		 274 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  46.12 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  47.06 
 
 		 289 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  47.06 
 
 		 289 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  46.19 
 
 		 279 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  42.58 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  46.12 
 
 		 251 aa  177  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  46.12 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  48.78 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  46.12 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  46.7 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  46.73 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  44.8 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  43.88 
 
 		 293 aa  171  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  46.01 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.42 
 
 		 322 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  38.37 
 
 		 325 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  40.88 
 
 		 297 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.42 
 
 		 322 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.42 
 
 		 322 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.42 
 
 		 322 aa  168  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.42 
 
 		 322 aa  167  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  41.42 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  40.42 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  36.06 
 
 		 331 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  40.34 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  37.69 
 
 		 307 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  40.08 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  39.34 
 
 		 272 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  42.23 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  40.54 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  40.44 
 
 		 290 aa  164  8e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  45.63 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  61.48 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  61.48 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>