More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1663 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  100 
 
 
262 aa  527  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  68.52 
 
 
267 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  45.85 
 
 
256 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  44.74 
 
 
261 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  45.06 
 
 
248 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  49.77 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  47.71 
 
 
244 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  47.71 
 
 
244 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  47.71 
 
 
244 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  47.71 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  47.71 
 
 
243 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  47.71 
 
 
243 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  45.54 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.54 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.54 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.54 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  41.18 
 
 
296 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  41.18 
 
 
296 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  45.54 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.54 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  44.86 
 
 
236 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  45.58 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  38.73 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  45.16 
 
 
238 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0423  putative lipoprotein NlpD  48.37 
 
 
254 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.897746  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2512  putative peptidase  48.37 
 
 
250 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1801  putative lipoprotein NlpD  48.37 
 
 
250 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  43.75 
 
 
294 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2373  putative peptidase  48.37 
 
 
343 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0472  putative lipoprotein NlpD  48.37 
 
 
250 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  41.67 
 
 
295 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0825  peptidase  48.37 
 
 
343 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  40.7 
 
 
292 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  44.76 
 
 
230 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  41.23 
 
 
295 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  44.55 
 
 
240 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  37.46 
 
 
312 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  42.24 
 
 
298 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  38.73 
 
 
289 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  42.24 
 
 
292 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  42.24 
 
 
296 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  42.24 
 
 
296 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  42.24 
 
 
296 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  38.73 
 
 
289 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  42.24 
 
 
296 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  39.92 
 
 
275 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  42.24 
 
 
296 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  38.21 
 
 
315 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  41.67 
 
 
292 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  44.19 
 
 
230 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  36.64 
 
 
311 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  42.99 
 
 
236 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  41.46 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  38.46 
 
 
317 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  39.15 
 
 
244 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  39.33 
 
 
252 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  42.47 
 
 
286 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  40.17 
 
 
274 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0634  lipoprotein NlpD, putative  46.83 
 
 
281 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0768696  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.6 
 
 
322 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.11 
 
 
287 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  39.62 
 
 
261 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  43.44 
 
 
284 aa  148  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1995  lipoprotein  40.87 
 
 
242 aa  149  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.6 
 
 
322 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  36 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.98 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  40.09 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.98 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.98 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  36.61 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  37.6 
 
 
315 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  37.6 
 
 
315 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  36.49 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  36.4 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  40.38 
 
 
268 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  41.04 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  40.89 
 
 
289 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  35.66 
 
 
318 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  36.06 
 
 
301 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  38.55 
 
 
240 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  39.11 
 
 
230 aa  142  5e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  35.64 
 
 
292 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  39.11 
 
 
230 aa  142  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  35.06 
 
 
299 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  42.65 
 
 
245 aa  142  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  44.19 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  38.43 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  40.93 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  36.1 
 
 
261 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  37.29 
 
 
293 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  36.73 
 
 
290 aa  138  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  42.66 
 
 
233 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  42.66 
 
 
233 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  37.05 
 
 
264 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  42.66 
 
 
233 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  36.59 
 
 
325 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  37.94 
 
 
284 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  38 
 
 
246 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  38.43 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>