More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4600 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  100 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  100 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  93.77 
 
 		 289 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  85.17 
 
 		 286 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  78.5 
 
 		 279 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  79.04 
 
 		 279 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  70.89 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.47 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.47 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.47 
 
 		 322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  50.47 
 
 		 315 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.16 
 
 		 322 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  50.16 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.47 
 
 		 322 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  47.13 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  52.81 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  49.62 
 
 		 331 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  72.14 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  44.3 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  44 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  45.18 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  48.42 
 
 		 236 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  44.49 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  43.97 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  38.11 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  45.25 
 
 		 233 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.25 
 
 		 233 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.25 
 
 		 233 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.25 
 
 		 233 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  45.25 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.25 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  43.4 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  43.4 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  45.45 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  40.87 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  44.34 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  43.89 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  38.69 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  38.41 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  41.18 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  37.83 
 
 		 292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  37.87 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  38.51 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  35.08 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  42.36 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  42.37 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  40.25 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  42.53 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  42.37 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  42.37 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  42.37 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  42.37 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  42.37 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  37.05 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  42.37 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  43.89 
 
 		 240 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  41 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  37.5 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  35.18 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  38.73 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.59 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  42.27 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  37.69 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  42.73 
 
 		 236 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  39.36 
 
 		 267 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  37.67 
 
 		 303 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  41.82 
 
 		 268 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  40.72 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  39.69 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  37.97 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  40.83 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  35.92 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  41.3 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  40.42 
 
 		 243 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  36.43 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  34.3 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  40.45 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  36.3 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  39.52 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  39.52 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  39.52 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  38.98 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  39.52 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  43.89 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  43.44 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  36.21 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  34.89 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  43.89 
 
 		 233 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  40.35 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  43.89 
 
 		 233 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  30.7 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  35.32 
 
 		 274 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  36.97 
 
 		 262 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  36.47 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  36.97 
 
 		 262 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  35.96 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  39.3 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  56.3 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  31.35 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  42.08 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>