More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1461 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  100 
 
 		 261 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  60.22 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  54.01 
 
 		 244 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1995  lipoprotein  54.43 
 
 		 242 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  43.43 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  47.6 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  41.92 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  45.45 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  43.33 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  41.52 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  43.33 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  39.86 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  44.35 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  38.52 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  39.26 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  39.7 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  45.71 
 
 		 230 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  44.55 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  44.28 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  44.28 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  43.3 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  39.55 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  41.6 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  43.42 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  40.73 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  39.16 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  41.22 
 
 		 246 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  41.52 
 
 		 301 aa  164  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  37.02 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  40.93 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  38.95 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  38.95 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  40.08 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  40.95 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  38.52 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  38.43 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  38.52 
 
 		 327 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  38.82 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  38.85 
 
 		 377 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  38.52 
 
 		 327 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  37.07 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  37.63 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  44.61 
 
 		 230 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  38.85 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  38.85 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  38.85 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  38.85 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  41.63 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  38.3 
 
 		 295 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  35.08 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  42.04 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  43.38 
 
 		 274 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  39.44 
 
 		 307 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  38.46 
 
 		 374 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  36.25 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  36.9 
 
 		 328 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  37.63 
 
 		 294 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  37.76 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  37.31 
 
 		 379 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  37.31 
 
 		 379 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  37.31 
 
 		 379 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  40.93 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  37.31 
 
 		 379 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  37.31 
 
 		 363 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  37.31 
 
 		 379 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  38.02 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  44.66 
 
 		 296 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  35.37 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.66 
 
 		 296 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  44.66 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.66 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  42.23 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.66 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.66 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  36.57 
 
 		 379 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  36.57 
 
 		 379 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  36.57 
 
 		 363 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  41.18 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  39.85 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  37.1 
 
 		 298 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  40.09 
 
 		 298 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  40.09 
 
 		 296 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  40.09 
 
 		 296 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  40.09 
 
 		 296 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  40.09 
 
 		 296 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  40.09 
 
 		 296 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  36.21 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  38.64 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  39.65 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  36.48 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  37.1 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  35.69 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  37.1 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  55.38 
 
 		 404 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  37.12 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  35.31 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  53.19 
 
 		 401 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  39.74 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  38.33 
 
 		 292 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  32.71 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>