More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0871 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  100 
 
 		 401 aa  810    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  70.36 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  61.19 
 
 		 345 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  59.2 
 
 		 344 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  58.71 
 
 		 327 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  58.71 
 
 		 327 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  58.71 
 
 		 327 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  52.2 
 
 		 363 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  51.45 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  51.92 
 
 		 377 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  51.45 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  51.92 
 
 		 377 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  53.69 
 
 		 328 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  51.45 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  51.92 
 
 		 377 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  52.4 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  51.45 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  51.92 
 
 		 377 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  51.45 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  52.64 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  51.46 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  50.72 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  50.72 
 
 		 379 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  45.12 
 
 		 290 aa  252  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  47.49 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  44.15 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  43.97 
 
 		 307 aa  235  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  43.23 
 
 		 296 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  42.12 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  40.33 
 
 		 272 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  43.52 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  42.67 
 
 		 298 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  42.67 
 
 		 298 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  41.69 
 
 		 289 aa  213  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  41.98 
 
 		 309 aa  212  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  38.75 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  39.53 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2507  lipoprotein  41.5 
 
 		 330 aa  209  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  42.32 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  42 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  40.2 
 
 		 298 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  40.96 
 
 		 298 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  42.05 
 
 		 298 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  39.63 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  40.48 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  40.53 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  41.72 
 
 		 298 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  41.11 
 
 		 283 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  42.11 
 
 		 293 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  54.17 
 
 		 249 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  39.06 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  61.43 
 
 		 250 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  61.43 
 
 		 250 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  61.43 
 
 		 250 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  41.1 
 
 		 297 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  61.43 
 
 		 250 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  60.71 
 
 		 250 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  60.71 
 
 		 251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  60.71 
 
 		 251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  60.71 
 
 		 250 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  60.71 
 
 		 251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  60.71 
 
 		 251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  60.71 
 
 		 251 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  60.71 
 
 		 251 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  60.71 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  60.71 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  35.33 
 
 		 367 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  39 
 
 		 333 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  60.43 
 
 		 248 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.6 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  57.04 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  37.81 
 
 		 360 aa  170  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  56.38 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  56.64 
 
 		 262 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  56.08 
 
 		 288 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  63.64 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  61.79 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  60.83 
 
 		 293 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  35.99 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  34.72 
 
 		 301 aa  159  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  53.28 
 
 		 260 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  46.63 
 
 		 257 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  44.92 
 
 		 270 aa  156  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  35.07 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  35.44 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  54.48 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  52.24 
 
 		 292 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  35.31 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  58.47 
 
 		 299 aa  153  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  55.37 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  59.32 
 
 		 292 aa  152  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  60.53 
 
 		 307 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  57.5 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  35.69 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  58.82 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  57.5 
 
 		 263 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  35.69 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  35.34 
 
 		 275 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  47.59 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  56.78 
 
 		 303 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>