More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1202 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  100 
 
 		 230 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  98.7 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  90.43 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  90.99 
 
 		 233 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  90.13 
 
 		 233 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  90.99 
 
 		 233 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  90.99 
 
 		 233 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  76.69 
 
 		 236 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  77.25 
 
 		 233 aa  341  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  77.25 
 
 		 233 aa  341  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  77.25 
 
 		 233 aa  341  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  77.25 
 
 		 233 aa  341  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  77.25 
 
 		 296 aa  341  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  77.25 
 
 		 296 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  74.47 
 
 		 295 aa  333  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  68.75 
 
 		 240 aa  328  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  68.53 
 
 		 238 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  68.91 
 
 		 236 aa  308  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  51.07 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  50.44 
 
 		 296 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  52.4 
 
 		 298 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  48.78 
 
 		 315 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  50.22 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  50 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  49.57 
 
 		 318 aa  215  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  48.55 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  50.44 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  50.44 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  49.55 
 
 		 292 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  48.32 
 
 		 312 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  50.22 
 
 		 295 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  50.89 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  48.5 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  49.35 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  51.09 
 
 		 298 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  51.09 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  51.09 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  51.09 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  51.09 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  51.09 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  51.09 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.83 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  52.73 
 
 		 292 aa  198  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  46.03 
 
 		 303 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  48.89 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  47.08 
 
 		 315 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  47.15 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  48.4 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  45.96 
 
 		 317 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  40.5 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  46.41 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  45.98 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  44.3 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  47.58 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  47.58 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  47.58 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  47.91 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  49.27 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  45.22 
 
 		 274 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  46.23 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  48.02 
 
 		 248 aa  180  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  48.78 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  46.41 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  47.03 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  47.14 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  46.19 
 
 		 279 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  47.34 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  47.34 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  47.34 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  47.34 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  47.34 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  39.23 
 
 		 307 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  40.8 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  46.73 
 
 		 284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  47.34 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  47.34 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  41.46 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  47.34 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  42.46 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  45.62 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  40.81 
 
 		 297 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  45.25 
 
 		 289 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  45.25 
 
 		 289 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  44.8 
 
 		 289 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  40.08 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  45.71 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  45.02 
 
 		 263 aa  168  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.84 
 
 		 322 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  41.84 
 
 		 315 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  63.11 
 
 		 303 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.84 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.84 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.84 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.84 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  41.2 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  41.84 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  38.69 
 
 		 288 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  45.71 
 
 		 262 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  45.79 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  39.73 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>