More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1037 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  61.98 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  48.36 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  48.43 
 
 		 275 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  49.53 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  50.22 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  48.58 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  48.88 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  47.49 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  47.69 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  47.69 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  47.69 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  47.69 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  47.69 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  47.69 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  42.74 
 
 		 295 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.11 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  45.38 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  48.58 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  49.33 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  47.69 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  39.69 
 
 		 252 aa  154  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  49.3 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  48.84 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  48.84 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  48.84 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  37.68 
 
 		 296 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  37.68 
 
 		 296 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  36.14 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  36.63 
 
 		 296 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  41.74 
 
 		 270 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  37.05 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  42.11 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  36.16 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  36.49 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  38.55 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  43.6 
 
 		 267 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  36.89 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  34.26 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  35.69 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  32.23 
 
 		 304 aa  138  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  35.11 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  37.7 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  39.3 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  39.3 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  39.3 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  37.75 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  39.3 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  39.3 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  39.3 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  39.3 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  39.5 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  39.5 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  39.5 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  36.67 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  36.67 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  36.67 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  36.91 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  37.23 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  36.67 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.8 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  36.67 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  37.28 
 
 		 298 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.8 
 
 		 322 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  35.98 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.15 
 
 		 322 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.15 
 
 		 322 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.15 
 
 		 322 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  38.15 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  37.8 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  38.25 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  36.53 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  35.74 
 
 		 318 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  41.63 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  35.22 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  39.42 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  35.22 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  37.5 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  35.22 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  37.23 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  33.7 
 
 		 289 aa  126  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  37.1 
 
 		 289 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  37.1 
 
 		 289 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  37.62 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  35.02 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  36.32 
 
 		 317 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  40.18 
 
 		 292 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  35.63 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  41.63 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  37.62 
 
 		 279 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  37.13 
 
 		 293 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  37.85 
 
 		 284 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  37.69 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  36.24 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  33.33 
 
 		 297 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  37.13 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  30.65 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  34.02 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  29.93 
 
 		 298 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  35.75 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>