More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0602 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 
296 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  100 
 
 
296 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  98.31 
 
 
236 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  82.09 
 
 
295 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  78.01 
 
 
239 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  76.82 
 
 
230 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  77.25 
 
 
230 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  72.53 
 
 
238 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  67.89 
 
 
240 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  72.88 
 
 
236 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  72.96 
 
 
233 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  72.53 
 
 
233 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  72.53 
 
 
233 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  72.53 
 
 
233 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  44.6 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  45 
 
 
296 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  45.16 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  45.16 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  44.96 
 
 
295 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  47.73 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  48.7 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  44.77 
 
 
294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  48.91 
 
 
298 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  44.36 
 
 
292 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  47.23 
 
 
318 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  46.25 
 
 
312 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  47.84 
 
 
299 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  47.86 
 
 
292 aa  205  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  48.47 
 
 
298 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  48.47 
 
 
296 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  48.47 
 
 
296 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  48.47 
 
 
296 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  48.47 
 
 
296 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  48.47 
 
 
296 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  41.1 
 
 
311 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  48.47 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  41.22 
 
 
315 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  45.38 
 
 
303 aa  198  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  42.03 
 
 
295 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  45.11 
 
 
317 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  47.73 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  47.71 
 
 
270 aa  195  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  42.38 
 
 
304 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.67 
 
 
287 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  48.86 
 
 
275 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  49.08 
 
 
274 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  48.13 
 
 
240 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  44.58 
 
 
315 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  47.42 
 
 
268 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  41.8 
 
 
295 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  43.25 
 
 
252 aa  185  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  44.83 
 
 
250 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  45.69 
 
 
251 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  45.69 
 
 
251 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  45.69 
 
 
251 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  45.69 
 
 
251 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  46.05 
 
 
250 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  46.05 
 
 
250 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  46.05 
 
 
250 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  47.17 
 
 
250 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  45.69 
 
 
251 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  46.67 
 
 
279 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  47.06 
 
 
289 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  43.86 
 
 
274 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  47.06 
 
 
289 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  46.12 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  46.19 
 
 
279 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  46.12 
 
 
251 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  46.7 
 
 
250 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  46.12 
 
 
251 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  42.74 
 
 
257 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  46.12 
 
 
251 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  48.78 
 
 
248 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  46.73 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  43.88 
 
 
293 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  44.8 
 
 
289 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  42.23 
 
 
262 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.42 
 
 
322 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  38.37 
 
 
325 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  40.08 
 
 
285 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  38.6 
 
 
272 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  40.88 
 
 
297 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  41.42 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.42 
 
 
322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.42 
 
 
322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.42 
 
 
322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41 
 
 
322 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  39.68 
 
 
289 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  39.82 
 
 
290 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  41 
 
 
315 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  37.69 
 
 
307 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  35.96 
 
 
331 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  41.09 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  45.63 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  42.23 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  61.48 
 
 
303 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>