More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3262 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  100 
 
 		 331 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  53.53 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  54.12 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  47.35 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  47.35 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  50.19 
 
 		 286 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  47.51 
 
 		 279 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  47.13 
 
 		 279 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  48.66 
 
 		 289 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.65 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.65 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.65 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  42.65 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.35 
 
 		 322 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  42.35 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.35 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  40.66 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  67.63 
 
 		 284 aa  215  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  40.52 
 
 		 311 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  40.38 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  38.41 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  39.1 
 
 		 230 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  37.83 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  36.14 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  36.14 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  38.49 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  38.49 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  37.74 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  36.94 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  36.62 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  35.63 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  39.39 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  37.41 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  35.34 
 
 		 257 aa  159  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  36.76 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  33.64 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  35.53 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.53 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  35.53 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  56.67 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.53 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.53 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.53 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  32.65 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  35.56 
 
 		 261 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  36.47 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  33.44 
 
 		 262 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  55.2 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  37.83 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  53.47 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  34.46 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  35.98 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  56.9 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  55 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  32.28 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  37.64 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  55 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  55 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  55.93 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  35.47 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  57.89 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  35.47 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  55.08 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  53.66 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  32.65 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  34.09 
 
 		 268 aa  145  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  35.31 
 
 		 267 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  31.89 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  55.93 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  50 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  33.45 
 
 		 333 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  37.36 
 
 		 284 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  34.08 
 
 		 275 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  34.32 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  33.09 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  37.17 
 
 		 233 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  37.17 
 
 		 233 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  37.17 
 
 		 233 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  34.7 
 
 		 377 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  34.7 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  34.7 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  34.7 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  32.71 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  33.58 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  36.43 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  33.58 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  32.84 
 
 		 377 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  33.96 
 
 		 261 aa  136  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  33.7 
 
 		 298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  32.84 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  33.58 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  43.12 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  33.58 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  33.46 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  32.84 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  32.84 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  32.84 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  32.84 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  32.84 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  42.94 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>