More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1284 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 
322 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  100 
 
 
315 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 
322 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  100 
 
 
322 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  99.37 
 
 
322 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  99.05 
 
 
315 aa  614  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  98.73 
 
 
322 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  81.23 
 
 
384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  54.63 
 
 
279 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  52.81 
 
 
289 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  52.81 
 
 
289 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  52.66 
 
 
286 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  53.35 
 
 
279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  54.31 
 
 
284 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  52.2 
 
 
289 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  45.29 
 
 
325 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  43.24 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  52.85 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  39.2 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  41.35 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  40.16 
 
 
315 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  35.51 
 
 
304 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  41.95 
 
 
295 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  36.99 
 
 
301 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  36.01 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  42.37 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  43.22 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  43.22 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  41.22 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  41.1 
 
 
298 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  41.1 
 
 
296 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  41.1 
 
 
292 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  41.1 
 
 
296 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  41.1 
 
 
296 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  38.28 
 
 
318 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  41.1 
 
 
296 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  41.1 
 
 
296 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  42.68 
 
 
230 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  36.01 
 
 
270 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  42.37 
 
 
292 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  42.37 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  41.84 
 
 
230 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  42.68 
 
 
236 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  42.02 
 
 
292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  36.93 
 
 
299 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  39.6 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  42.74 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  38.91 
 
 
315 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  40.17 
 
 
233 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.95 
 
 
287 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  40.17 
 
 
296 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.17 
 
 
296 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.17 
 
 
233 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.17 
 
 
233 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.17 
 
 
233 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  35.28 
 
 
298 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  36.84 
 
 
303 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  40.17 
 
 
295 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  40.09 
 
 
240 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  38.56 
 
 
261 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  35.16 
 
 
252 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  43.1 
 
 
238 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  39.41 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  36.45 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  37.29 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  37.29 
 
 
275 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  41.38 
 
 
236 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  35.59 
 
 
248 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  43.1 
 
 
233 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  33.78 
 
 
256 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  40.3 
 
 
267 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  43.1 
 
 
233 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  43.1 
 
 
233 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  38.37 
 
 
264 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  38.8 
 
 
243 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  42.68 
 
 
233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  36.4 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  38.4 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  41 
 
 
239 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  32.51 
 
 
283 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  38 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  38 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  38 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  38 
 
 
244 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  37.74 
 
 
245 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  35.15 
 
 
290 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  39.48 
 
 
292 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  38.56 
 
 
297 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  35.92 
 
 
257 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  33.68 
 
 
296 aa  142  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  39.83 
 
 
261 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  34.41 
 
 
360 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  37.86 
 
 
261 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  36.74 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  52.07 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  35.51 
 
 
261 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  31.32 
 
 
311 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  51.64 
 
 
303 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  35.66 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  33.73 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>