More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1162 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  100 
 
 		 303 aa  600  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  99.01 
 
 		 303 aa  595  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  74.1 
 
 		 299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  70.3 
 
 		 292 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  65.69 
 
 		 295 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  62.8 
 
 		 292 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  63.09 
 
 		 298 aa  336  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  65.03 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  62.33 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  60.78 
 
 		 301 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  57.14 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  51.39 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  51.39 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  48.72 
 
 		 315 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  53.36 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  52.88 
 
 		 312 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  51.55 
 
 		 296 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  53.71 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  49.03 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  51.94 
 
 		 292 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  52.11 
 
 		 294 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  52.03 
 
 		 298 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  52.03 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  52.03 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  52.03 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  52.03 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  52.03 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  48.75 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  51.84 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  56.85 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  49.47 
 
 		 287 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  57.02 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  49.27 
 
 		 275 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  51.09 
 
 		 274 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  52.34 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  48.37 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  49.37 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  42.24 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  48.95 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  49.16 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  45 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  45.38 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.38 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  45.38 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.38 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  50.42 
 
 		 238 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.38 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.38 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  48.54 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  49.16 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  43 
 
 		 252 aa  205  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  45.89 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  47.9 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  49.16 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  46.21 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  39.29 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  46.86 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  48.54 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  45.45 
 
 		 284 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  42.8 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  42.8 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  42.8 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  42.8 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  42.8 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  42.8 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  48.12 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  43.8 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  43.8 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  43.8 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  43.8 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  43.8 
 
 		 377 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  41.02 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  45.83 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  48.54 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  39.12 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  47.06 
 
 		 233 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  45 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  46.64 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  46.64 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  40.86 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  40.86 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  46.22 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  40.86 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  37.81 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  49.17 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  37.81 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  41.47 
 
 		 374 aa  178  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  37.81 
 
 		 327 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  39.57 
 
 		 290 aa  178  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  34.97 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  42.91 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  43.93 
 
 		 261 aa  175  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  41.15 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  37.21 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  41 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  37.21 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  37.21 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  40.3 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  37.21 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  43.59 
 
 		 286 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>