More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6258 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  100 
 
 
296 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  100 
 
 
296 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  96.62 
 
 
296 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  93.24 
 
 
295 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  92.23 
 
 
295 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  90.54 
 
 
294 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  91.22 
 
 
292 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  74.6 
 
 
298 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  71.97 
 
 
311 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  72.24 
 
 
312 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  74.43 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  69.84 
 
 
315 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  74.43 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  74.43 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  74.43 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  74.43 
 
 
296 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  74.1 
 
 
292 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  75.77 
 
 
292 aa  362  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  52.9 
 
 
318 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  55.26 
 
 
295 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  53.93 
 
 
301 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  51.65 
 
 
292 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  52.3 
 
 
287 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  52.7 
 
 
298 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  49.5 
 
 
299 aa  255  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  52.92 
 
 
275 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  53.7 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  54.26 
 
 
274 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  46.53 
 
 
304 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  51.58 
 
 
303 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  47.21 
 
 
295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  51.38 
 
 
292 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  51.58 
 
 
303 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  51.85 
 
 
317 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  50 
 
 
315 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  51.01 
 
 
238 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  51.3 
 
 
230 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  50 
 
 
240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  50.61 
 
 
236 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  50.21 
 
 
233 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.21 
 
 
233 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.21 
 
 
233 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.21 
 
 
233 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  50.21 
 
 
296 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.21 
 
 
296 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  44.93 
 
 
270 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  45.55 
 
 
252 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  50.64 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  49.35 
 
 
230 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  48.46 
 
 
295 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  50.22 
 
 
239 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  52.17 
 
 
233 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  51.74 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  51.74 
 
 
233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  46.15 
 
 
293 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  51.3 
 
 
233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  42.28 
 
 
285 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  44.4 
 
 
257 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  47.16 
 
 
264 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  41.59 
 
 
333 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  43.93 
 
 
297 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  39.82 
 
 
360 aa  190  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  45.85 
 
 
274 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  43.17 
 
 
230 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  43.37 
 
 
262 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  42.91 
 
 
262 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  43.17 
 
 
230 aa  189  5e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  41.09 
 
 
261 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  37.99 
 
 
288 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  42.25 
 
 
309 aa  185  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  46.93 
 
 
297 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  44.44 
 
 
284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  45.02 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  42.14 
 
 
289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  42.14 
 
 
289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  41.15 
 
 
384 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  39.58 
 
 
293 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  44.98 
 
 
286 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  37.67 
 
 
288 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  39.78 
 
 
248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  39.64 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  39.72 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  41.5 
 
 
262 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  43.64 
 
 
322 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  43.64 
 
 
322 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  43.64 
 
 
322 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  38.98 
 
 
290 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  43.64 
 
 
315 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  43.22 
 
 
322 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1654  lipoprotein NlpD, putative  71.93 
 
 
186 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  42.86 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  44.87 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  38.62 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  42.62 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  38.61 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  36.23 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  42.41 
 
 
279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  43.75 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.37 
 
 
322 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  36.5 
 
 
311 aa  172  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>