More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2205 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  100 
 
 
256 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  90.42 
 
 
261 aa  460  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  60.85 
 
 
248 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  49.8 
 
 
244 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  49.8 
 
 
244 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  49.8 
 
 
244 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  51.28 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  49.8 
 
 
244 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  50.21 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  50.21 
 
 
243 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  45.85 
 
 
262 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  47.37 
 
 
267 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0423  putative lipoprotein NlpD  46.12 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.897746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2373  putative peptidase  46.12 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0825  peptidase  46.12 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1801  putative lipoprotein NlpD  46.12 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2512  putative peptidase  46.12 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0472  putative lipoprotein NlpD  46.12 
 
 
250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  38.49 
 
 
297 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  38.85 
 
 
295 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  39.86 
 
 
296 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0634  lipoprotein NlpD, putative  45.26 
 
 
281 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0768696  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  39.86 
 
 
296 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  39.86 
 
 
296 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  40.74 
 
 
315 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  40.29 
 
 
292 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  36.51 
 
 
312 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  37.46 
 
 
295 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  40.42 
 
 
311 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  38.63 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  42.27 
 
 
286 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  37.05 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  37.05 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  41.56 
 
 
298 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  41.56 
 
 
296 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  41.56 
 
 
292 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  41.56 
 
 
296 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  41.56 
 
 
296 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  41.56 
 
 
296 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  41.56 
 
 
296 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  36.94 
 
 
279 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  40.61 
 
 
292 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  42.33 
 
 
279 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  40.37 
 
 
284 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.29 
 
 
322 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  39.06 
 
 
317 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  41.01 
 
 
301 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.29 
 
 
322 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  39.91 
 
 
289 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  44.02 
 
 
230 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  37.29 
 
 
315 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  39.34 
 
 
252 aa  148  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  43.75 
 
 
230 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  39.11 
 
 
275 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  42.18 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  42.18 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.18 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.18 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.18 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.18 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  39.91 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  36.86 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.86 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.86 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.86 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  37.36 
 
 
285 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  39.17 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  40.27 
 
 
298 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  41.59 
 
 
236 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  38.43 
 
 
318 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  39.81 
 
 
268 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  41.12 
 
 
261 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  35.46 
 
 
292 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  39.81 
 
 
295 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  36.94 
 
 
262 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  34.91 
 
 
297 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  40.83 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  39.91 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  35.9 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  51.67 
 
 
325 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  36.57 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  35.32 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  40.8 
 
 
244 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  40.65 
 
 
236 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  35.39 
 
 
295 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  39.15 
 
 
293 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  37.17 
 
 
274 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  44.98 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0661  peptidase M23B  33.33 
 
 
270 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0851983  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  37.7 
 
 
240 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  34.13 
 
 
287 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  40.85 
 
 
238 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  39.3 
 
 
299 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0690  hypothetical protein  34.67 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105765  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  38.81 
 
 
292 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  50 
 
 
329 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  40.91 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  36.91 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  34.66 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  36.89 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>