More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4030 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  95.7 
 
 		 279 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  79.11 
 
 		 289 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  79.11 
 
 		 289 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  78.4 
 
 		 286 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  78.35 
 
 		 289 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  71.58 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  53.65 
 
 		 322 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  53.65 
 
 		 322 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  53.65 
 
 		 322 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  53.65 
 
 		 315 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  53.33 
 
 		 322 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  52.38 
 
 		 322 aa  292  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  53.33 
 
 		 315 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  50.93 
 
 		 384 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  53.75 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  46.74 
 
 		 331 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  70.71 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  47.62 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  46.67 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  46.67 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  46.67 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  46.67 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  46.67 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  46.67 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  42.73 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  44.76 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  43.06 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  46.67 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  42.73 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  37.88 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  41.32 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  41.96 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  41.96 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  42.92 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  43.81 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  38.97 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  42.02 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  43.64 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  45.24 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  38.75 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  41.09 
 
 		 318 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  38.95 
 
 		 270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  42.54 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  42.54 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  42.54 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  42.54 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  42.54 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  42.54 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  42.54 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  42.58 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  41.1 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  39.46 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  38.97 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  37.69 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  38.91 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  41.51 
 
 		 236 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  39.53 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  42.65 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  42.58 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  36.75 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  38.76 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  40.34 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  37.36 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  36.5 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  35.18 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  45.24 
 
 		 233 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  44.76 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  45.24 
 
 		 233 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  45.24 
 
 		 233 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  34.56 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  40.6 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  37.77 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  39.74 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  31.72 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  33.59 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  35.99 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  56.3 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  43.33 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  34.17 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  39.91 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  40.59 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  40.17 
 
 		 244 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  40.43 
 
 		 243 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  40.17 
 
 		 244 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  40.17 
 
 		 244 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  40.43 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  38.05 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  39.65 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  36.33 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  38.46 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  37.19 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  36.82 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  55.46 
 
 		 303 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  55.46 
 
 		 303 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  38.16 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  52.54 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  34.12 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  36.9 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  32.29 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>