More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0657 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  100 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  79.84 
 
 		 270 aa  421  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  46.01 
 
 		 295 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  43.1 
 
 		 315 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  45.91 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  42 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  49.79 
 
 		 275 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  44.84 
 
 		 296 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  44.84 
 
 		 296 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  44.64 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  44.03 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  46.76 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  45.16 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  40.73 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  50 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  41.53 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  44.13 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  42.69 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  44.37 
 
 		 287 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  41.84 
 
 		 292 aa  195  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  42.24 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  50 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  42.96 
 
 		 318 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  43.01 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  43.01 
 
 		 296 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  43.01 
 
 		 296 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  43.01 
 
 		 292 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  43.01 
 
 		 296 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  43.01 
 
 		 296 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  43.01 
 
 		 296 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  39.19 
 
 		 298 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  46.23 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  45.28 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.28 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  45.28 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  44.87 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.28 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.28 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  35.87 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.28 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  46.05 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  39.03 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  44.6 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  44.19 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  44.81 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  46.7 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  45.58 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  40.53 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  40.45 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  40.52 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  39.03 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  43.43 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  38.99 
 
 		 285 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  64.17 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  43.43 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  33.12 
 
 		 333 aa  164  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  37.2 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  37.72 
 
 		 288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  37.87 
 
 		 289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  37.87 
 
 		 289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  66.96 
 
 		 360 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  41.05 
 
 		 284 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  39.62 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  38.11 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  39.62 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  39.48 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.29 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  64.96 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  64.96 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  39.13 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  45.28 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  45.28 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  38.02 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  35.4 
 
 		 293 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  44.39 
 
 		 279 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  45.75 
 
 		 233 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  38.7 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  44.81 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  43.51 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  39.74 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  37.45 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  39.84 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  39.84 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  39.84 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  34.42 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  39.84 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  39.92 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  39.69 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  39.92 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  39.92 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  39.84 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  35.14 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  33.87 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  35.22 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  39.33 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  37.6 
 
 		 374 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  37.92 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  34.84 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  39.29 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  37.17 
 
 		 307 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>