More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1244 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  100 
 
 
286 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  85.17 
 
 
289 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  85.17 
 
 
289 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  83.79 
 
 
289 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  80.49 
 
 
279 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  77.93 
 
 
279 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  72.82 
 
 
284 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  51.08 
 
 
322 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  51.08 
 
 
322 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  51.08 
 
 
322 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  51.08 
 
 
315 aa  298  6e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  50.46 
 
 
384 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.77 
 
 
322 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  50.77 
 
 
322 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  50.77 
 
 
315 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  53.23 
 
 
325 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  48.47 
 
 
331 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  70.07 
 
 
329 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  39.04 
 
 
312 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  44.84 
 
 
301 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  46.08 
 
 
236 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  44.74 
 
 
295 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  44.44 
 
 
294 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  43.53 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  44.3 
 
 
295 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  40.62 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  38.26 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  44.2 
 
 
233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  44.2 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.2 
 
 
233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.2 
 
 
233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  44.54 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.2 
 
 
233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  44.54 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.2 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  39.45 
 
 
299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  45.62 
 
 
295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  38.26 
 
 
315 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  39.19 
 
 
311 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  39.78 
 
 
318 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  45.33 
 
 
292 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  40.81 
 
 
270 aa  169  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  38.55 
 
 
256 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  40.91 
 
 
315 aa  168  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  45.16 
 
 
230 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  39.03 
 
 
252 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  41.67 
 
 
298 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  41.67 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  41.67 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  41.67 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  41.67 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  41.67 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  41.67 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  43.78 
 
 
230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  35.95 
 
 
304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  38.38 
 
 
261 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  43.78 
 
 
240 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  38.05 
 
 
295 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  42.67 
 
 
287 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  38.98 
 
 
317 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  40.07 
 
 
262 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  39.33 
 
 
295 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  40.53 
 
 
268 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  37.16 
 
 
297 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  42.5 
 
 
267 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  41.2 
 
 
248 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  38.68 
 
 
243 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  37.98 
 
 
243 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  37.63 
 
 
244 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  37.63 
 
 
244 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  37.63 
 
 
244 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  35.23 
 
 
257 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  57.85 
 
 
292 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  42.59 
 
 
238 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  41.2 
 
 
236 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  39.39 
 
 
274 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  36.59 
 
 
261 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  40.76 
 
 
261 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  40.95 
 
 
293 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  40.35 
 
 
292 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  36.8 
 
 
274 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  37.68 
 
 
244 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  40.52 
 
 
275 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  38.06 
 
 
245 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  36.73 
 
 
297 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  40.61 
 
 
264 aa  146  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  57.98 
 
 
303 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  57.98 
 
 
303 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  39.08 
 
 
285 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  33.08 
 
 
283 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  36.73 
 
 
290 aa  143  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  43.32 
 
 
233 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  42.86 
 
 
233 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  37.5 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  37.1 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  42.4 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  43.32 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  43.32 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  41.2 
 
 
263 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  31.16 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>