More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4456 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  95.9 
 
 		 244 aa  453  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  89.34 
 
 		 243 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  88.93 
 
 		 243 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  84.96 
 
 		 245 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2373  putative peptidase  69.86 
 
 		 343 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0825  peptidase  69.41 
 
 		 343 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0423  putative lipoprotein NlpD  69.41 
 
 		 254 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.897746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0472  putative lipoprotein NlpD  69.41 
 
 		 250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1801  putative lipoprotein NlpD  69.41 
 
 		 250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2512  putative peptidase  69.41 
 
 		 250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0634  lipoprotein NlpD, putative  68.81 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0768696  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  50.2 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  52.52 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  48.11 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  47.49 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  45.21 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  39.65 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  39.65 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  39.65 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  39.56 
 
 		 292 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  39.21 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  42.16 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.16 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.16 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.16 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  42.16 
 
 		 296 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.16 
 
 		 296 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  44.28 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  38.28 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  43.78 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  41.06 
 
 		 236 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  37.45 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  38.05 
 
 		 295 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  37.45 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  37.61 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.3 
 
 		 287 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  38 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  36.75 
 
 		 298 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  36.75 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  36.75 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  36.75 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  36.75 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  36.75 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  36.75 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  38.96 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.6 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.6 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.6 
 
 		 322 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  40.64 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  37.72 
 
 		 292 aa  144  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  38.77 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  40.2 
 
 		 295 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  38.7 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  37.77 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  39.81 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  35.34 
 
 		 279 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  39.73 
 
 		 284 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  39.52 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  38.04 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  42.44 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  36.8 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  45.27 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  37.02 
 
 		 270 aa  138  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  38.26 
 
 		 299 aa  138  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  45.1 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  45.1 
 
 		 233 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  45.1 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  38.07 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  39.3 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  36.51 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  40.2 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  45.1 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  38.79 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  32.84 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  37 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  38.07 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  38.03 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  35 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  35 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  37.85 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  33.71 
 
 		 285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1995  lipoprotein  38.01 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  36.76 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  38.24 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  31.97 
 
 		 288 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  33.71 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  35.86 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  50.82 
 
 		 329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  35.02 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  35.92 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  47.45 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  35.02 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  31.79 
 
 		 304 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  37.39 
 
 		 318 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.65 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>