More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1995 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1995  lipoprotein  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  95.49 
 
 		 244 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  55.95 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  53.31 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  38.08 
 
 		 288 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  39.93 
 
 		 285 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  40.36 
 
 		 297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  44.94 
 
 		 293 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  40 
 
 		 262 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  40.3 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  40.47 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.87 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  42.15 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  40.15 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  40.38 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  37.45 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  34.74 
 
 		 307 aa  158  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  38.13 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  36.92 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  42.18 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  38.1 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  35.32 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  40.09 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  35.74 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  42.38 
 
 		 274 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  34.75 
 
 		 307 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  41.96 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  38.08 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  37.61 
 
 		 290 aa  149  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  43.13 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  35.31 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  35.25 
 
 		 311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  36.21 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  36.21 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  35.25 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  39.01 
 
 		 295 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  39.55 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  39.29 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  37.71 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  38.18 
 
 		 286 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  37.5 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  36.82 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  35.33 
 
 		 309 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  39.63 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  37.05 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  37.2 
 
 		 250 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  39.38 
 
 		 296 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  34.93 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  36.93 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  39.38 
 
 		 296 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  48.17 
 
 		 377 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  48.17 
 
 		 377 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  48.17 
 
 		 377 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  48.17 
 
 		 377 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  43.35 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  48.17 
 
 		 377 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  37.2 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  37.2 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  37.2 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  37.2 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  32.29 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  42 
 
 		 245 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  39.08 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  37.2 
 
 		 251 aa  141  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  38.12 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  36.29 
 
 		 298 aa  141  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  36.29 
 
 		 298 aa  141  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  36.09 
 
 		 261 aa  141  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  33.67 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  35.71 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  37.3 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  38.15 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  35.22 
 
 		 310 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  33.33 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  56.78 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  41.38 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  40.38 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  40.54 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  36.33 
 
 		 374 aa  138  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  37.4 
 
 		 379 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  38.77 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  37.4 
 
 		 379 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  39.64 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  37.4 
 
 		 363 aa  138  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  37.4 
 
 		 379 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  39.66 
 
 		 317 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  37.4 
 
 		 379 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  37.4 
 
 		 379 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  35.48 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1246  novel lipoprotein homolog NlpD  36.1 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  37.7 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  35.48 
 
 		 298 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  37.7 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  37.7 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  38.03 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  37.89 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  38.32 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  37.89 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  37.89 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  40 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>