More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1073 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  63.22 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  47.79 
 
 		 275 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  47.11 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  49.53 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  43.37 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  44.12 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.07 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  46.41 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  43.59 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  43.31 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  45.66 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  45.87 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.87 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.87 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.87 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  45.87 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.87 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  46.46 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  45.93 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  40 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  43.52 
 
 		 295 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  40.37 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  42.34 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  44.76 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  41.78 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  41.59 
 
 		 296 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  41.59 
 
 		 296 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  44.76 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  44.76 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  44.76 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  40.27 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  38.52 
 
 		 270 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  36.64 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  39.73 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  39.84 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  40.09 
 
 		 292 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  36.21 
 
 		 315 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  38.34 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  40 
 
 		 295 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  39.92 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  36.33 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  36.33 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  36.33 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  36.33 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  39.91 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  36.33 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  37.9 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  36.51 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  39.81 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  41.23 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  38.36 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  37.07 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  34.23 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  36.21 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  37.29 
 
 		 312 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  36.48 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  36.33 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  36.33 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  36.33 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  37.05 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  38.43 
 
 		 298 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  37.05 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  37.05 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  38.43 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  38.43 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  38.43 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  38.43 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  38.43 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  38.43 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  40.38 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  36.8 
 
 		 318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  34.27 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  37.9 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  34.4 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  39.71 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  37.07 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  37.66 
 
 		 299 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  34.83 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  38.92 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  39.22 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  37.55 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  33.76 
 
 		 285 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  38.65 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  38.65 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  38.65 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  38.32 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  33.33 
 
 		 438 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  38.39 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  38.24 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  37.85 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  31.29 
 
 		 294 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  29.93 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  36.68 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  34.45 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  36.29 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  37.44 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  36.07 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  35.77 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  36.07 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>