More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0549 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  44.91 
 
 
264 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  44.74 
 
 
295 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  44.98 
 
 
296 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  43.72 
 
 
312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  42.57 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  44.35 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  42.45 
 
 
311 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  45.41 
 
 
296 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  45.41 
 
 
296 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  44.49 
 
 
294 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  43.53 
 
 
293 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  43.59 
 
 
292 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  38.63 
 
 
285 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  42.53 
 
 
301 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  41.38 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  41.42 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  39.92 
 
 
317 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  40.47 
 
 
263 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  41.88 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  45.26 
 
 
292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  41.88 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  41.88 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  41.88 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  41.88 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  42.06 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  41.88 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  41.88 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  40.55 
 
 
261 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  38.82 
 
 
257 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.31 
 
 
304 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  39.64 
 
 
244 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  41.13 
 
 
284 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  42.45 
 
 
230 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  38.02 
 
 
252 aa  159  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  41.63 
 
 
299 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  41.13 
 
 
297 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  41.3 
 
 
298 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  39.58 
 
 
262 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  41.05 
 
 
262 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  39.42 
 
 
315 aa  155  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  43.4 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  36.76 
 
 
279 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  42.47 
 
 
268 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  37.7 
 
 
230 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.81 
 
 
296 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  44.81 
 
 
296 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  38.37 
 
 
270 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  41.84 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  44.81 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.2 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.81 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.81 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  37.7 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.81 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  40 
 
 
245 aa  152  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  41.86 
 
 
240 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  35.38 
 
 
285 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  39.04 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  44.13 
 
 
236 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  34.03 
 
 
285 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  42.72 
 
 
267 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  36.59 
 
 
286 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  36.76 
 
 
279 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  43.05 
 
 
292 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  37.18 
 
 
272 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  41.45 
 
 
274 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  35.92 
 
 
289 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  35.92 
 
 
289 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  40.47 
 
 
246 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  36.09 
 
 
265 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1995  lipoprotein  40.65 
 
 
242 aa  149  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  35.13 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1246  novel lipoprotein homolog NlpD  38.43 
 
 
247 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  42.99 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  37.34 
 
 
289 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  41.82 
 
 
275 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  38.96 
 
 
288 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  41.84 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  40.09 
 
 
248 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  36.27 
 
 
289 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  38.08 
 
 
295 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1246  novel lipoprotein homolog NlpD  37.65 
 
 
247 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  43.4 
 
 
295 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  35.69 
 
 
310 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  41.94 
 
 
274 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  33.58 
 
 
307 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  41.04 
 
 
238 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  36.09 
 
 
345 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  35.34 
 
 
284 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  36.97 
 
 
250 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  36.97 
 
 
250 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  38.08 
 
 
293 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  36.97 
 
 
250 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  35.74 
 
 
374 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  34.2 
 
 
328 aa  141  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  37.67 
 
 
260 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  41.38 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  35.27 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  36.43 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>