More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1246 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1246  novel lipoprotein homolog NlpD  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1246  novel lipoprotein homolog NlpD  98.79 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  41.22 
 
 
230 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  41.22 
 
 
230 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  43.48 
 
 
293 aa  158  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  38.79 
 
 
296 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  42.01 
 
 
265 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  39.15 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  43.17 
 
 
261 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  36.43 
 
 
283 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  39.67 
 
 
260 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  38.43 
 
 
288 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  35.84 
 
 
298 aa  148  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  39.82 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  39.38 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  39.57 
 
 
262 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  39.57 
 
 
262 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  36.86 
 
 
264 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  38.03 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  35.93 
 
 
298 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  35.93 
 
 
298 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  37.65 
 
 
261 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  35.74 
 
 
298 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  36.55 
 
 
290 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  35.71 
 
 
289 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  35.15 
 
 
298 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  40.79 
 
 
284 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  37.75 
 
 
250 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  35.96 
 
 
272 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  36.88 
 
 
298 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  36.88 
 
 
298 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  36.88 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  37.55 
 
 
288 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  38.35 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  36.44 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  36.44 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  36.44 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  36.44 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  37.32 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  37.45 
 
 
246 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  33.44 
 
 
307 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  35.82 
 
 
296 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  34.94 
 
 
310 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  34.78 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  37.5 
 
 
261 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  31.95 
 
 
345 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  36.44 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  36.03 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  36.44 
 
 
251 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  36.44 
 
 
251 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  32.31 
 
 
328 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  44.12 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  35.27 
 
 
304 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  36.29 
 
 
301 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  32.14 
 
 
307 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  34.69 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  37.89 
 
 
309 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  34.66 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
379 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  35.43 
 
 
379 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  35.43 
 
 
379 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  35.43 
 
 
363 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  35.43 
 
 
379 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  35.43 
 
 
379 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  35.43 
 
 
379 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  35.43 
 
 
363 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  35.43 
 
 
379 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  35.83 
 
 
377 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  35.43 
 
 
377 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  36.11 
 
 
327 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  35.43 
 
 
377 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  35.43 
 
 
377 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  35.43 
 
 
377 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  36.11 
 
 
327 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  33.94 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  33.94 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  33.33 
 
 
312 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  32.09 
 
 
311 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  35.71 
 
 
344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  30.85 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  33.7 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  38.94 
 
 
248 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  36.51 
 
 
250 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  36.51 
 
 
250 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  39.42 
 
 
323 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  36.51 
 
 
250 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  37.34 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  32.9 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  33.72 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  31.67 
 
 
315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  31.02 
 
 
311 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  34.25 
 
 
374 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  35.5 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  32.85 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  32.85 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  32.85 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  32.85 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  37.86 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  37.66 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  32.85 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>