More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4053 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  100 
 
 		 285 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  87.02 
 
 		 285 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  87.02 
 
 		 262 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  86.64 
 
 		 262 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  66.1 
 
 		 288 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  67.67 
 
 		 293 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  65.42 
 
 		 288 aa  357  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  62.2 
 
 		 297 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  63.16 
 
 		 293 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  59.23 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  60.27 
 
 		 307 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  49.22 
 
 		 260 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  46.72 
 
 		 261 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  42.61 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  42.61 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  42.27 
 
 		 327 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  40.12 
 
 		 401 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  44.37 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  40.69 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.89 
 
 		 304 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  39.94 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  42.25 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  43.68 
 
 		 265 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  40.61 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  45.38 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  40.61 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  40.96 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  45.41 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  39.58 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  40.96 
 
 		 298 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  42.81 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  42.97 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  42.97 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  42.97 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  42.97 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  42.97 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  43.97 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  43.58 
 
 		 374 aa  195  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  44.23 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  44.23 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  44.23 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  44.23 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  44.23 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  39.86 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  44.23 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  38.35 
 
 		 272 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  42.12 
 
 		 249 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  41.5 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  39.86 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  39.86 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  41.16 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  40.52 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  42.8 
 
 		 298 aa  188  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  39.93 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  45.73 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  40.21 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  40.21 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  41.09 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  40.34 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  45 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  44.83 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  40.57 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  44.86 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  45.92 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  40.57 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  37.42 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  37.62 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  41.38 
 
 		 363 aa  185  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  41.38 
 
 		 379 aa  185  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  41.38 
 
 		 379 aa  185  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  40.12 
 
 		 360 aa  185  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  37.94 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  40.21 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  42.05 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  41.4 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  46.22 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  36.67 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  41.4 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  41.4 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  41.4 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  41.4 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  41.4 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  41.4 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  39.25 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  42.45 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  38.61 
 
 		 304 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  40.43 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  39.78 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  40.43 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  40.43 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  39.02 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  39.71 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  39.44 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  39.44 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  39.1 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  39.25 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  40.62 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  46.28 
 
 		 274 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  45.02 
 
 		 292 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  39.29 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>