More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3213 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  100 
 
 
374 aa  757    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  78.57 
 
 
377 aa  577  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  78.57 
 
 
377 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  78.57 
 
 
377 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  78.31 
 
 
377 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  78.57 
 
 
377 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  77.81 
 
 
363 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  74.54 
 
 
379 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  74.54 
 
 
379 aa  543  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  74.54 
 
 
379 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  74.54 
 
 
379 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  74.54 
 
 
379 aa  543  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  77.81 
 
 
363 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  74.54 
 
 
379 aa  525  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  74.54 
 
 
379 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  56.58 
 
 
345 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  57.1 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  58.71 
 
 
327 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  57.91 
 
 
327 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  55.94 
 
 
344 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  52.88 
 
 
401 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  56.37 
 
 
328 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  51.54 
 
 
404 aa  358  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  47.6 
 
 
290 aa  249  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  46.15 
 
 
249 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  45.05 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  47.04 
 
 
311 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  44.03 
 
 
307 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  45.85 
 
 
310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  45.35 
 
 
289 aa  222  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  44.4 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  47.08 
 
 
309 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  46.15 
 
 
296 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  39.71 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2507  lipoprotein  44.64 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  44.06 
 
 
298 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  44.91 
 
 
298 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  45.58 
 
 
304 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  43.63 
 
 
298 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  43.24 
 
 
298 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  45.17 
 
 
283 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  43.17 
 
 
294 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  42.86 
 
 
298 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  45.09 
 
 
298 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  45.09 
 
 
298 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  44.7 
 
 
293 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  43.89 
 
 
285 aa  205  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  42.07 
 
 
298 aa  203  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  41.87 
 
 
311 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  43.02 
 
 
250 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  43.33 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  42.16 
 
 
262 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  43.77 
 
 
250 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  43.77 
 
 
250 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  43.77 
 
 
250 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  42.91 
 
 
262 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  43.4 
 
 
250 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  41.26 
 
 
285 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  42.69 
 
 
297 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  42.26 
 
 
250 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  41.51 
 
 
251 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  41.51 
 
 
251 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  43.85 
 
 
288 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  41.51 
 
 
251 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  41.51 
 
 
251 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  43.58 
 
 
284 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  41.51 
 
 
251 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  40.31 
 
 
257 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  42.8 
 
 
288 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  40.3 
 
 
304 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  41.25 
 
 
293 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  40.54 
 
 
261 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  43.97 
 
 
317 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  37.85 
 
 
367 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  38.35 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  40.08 
 
 
301 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  40.6 
 
 
248 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  42.21 
 
 
307 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  57.64 
 
 
251 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  57.64 
 
 
251 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  57.64 
 
 
251 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  39.77 
 
 
318 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  36.43 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  36.5 
 
 
260 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  34.78 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  40 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  39.53 
 
 
299 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  42.41 
 
 
295 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.61 
 
 
287 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  36.98 
 
 
296 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  40.08 
 
 
315 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  38.52 
 
 
298 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  60.16 
 
 
285 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  35.96 
 
 
309 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  38.43 
 
 
268 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  38.22 
 
 
270 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  38.52 
 
 
292 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  37.36 
 
 
311 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  37.65 
 
 
292 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  53.74 
 
 
263 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>