More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3206 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  100 
 
 		 250 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  99.2 
 
 		 250 aa  503  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  99.2 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  85.71 
 
 		 251 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  85.71 
 
 		 251 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  85.71 
 
 		 251 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  85.71 
 
 		 251 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  85.71 
 
 		 251 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  84.52 
 
 		 250 aa  434  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  86.11 
 
 		 251 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  85.71 
 
 		 251 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  86.11 
 
 		 251 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  77.78 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  55.78 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  46.95 
 
 		 327 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  46.56 
 
 		 327 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  46.56 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  45.45 
 
 		 290 aa  218  7e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  40.07 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  43.23 
 
 		 377 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  43.23 
 
 		 377 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  43.23 
 
 		 377 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  43.23 
 
 		 377 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  43.73 
 
 		 379 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  43.73 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  43.73 
 
 		 379 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  44.74 
 
 		 374 aa  205  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  43.61 
 
 		 377 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  37.98 
 
 		 289 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  42.29 
 
 		 272 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  41.33 
 
 		 311 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  42.17 
 
 		 310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  47.44 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  39.86 
 
 		 283 aa  188  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  38.78 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  38.78 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  38.78 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  41.88 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  38.44 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  67.8 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  42.55 
 
 		 297 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  38.43 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  61.43 
 
 		 401 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  47.66 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  46.09 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  67.8 
 
 		 344 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  67.8 
 
 		 345 aa  181  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  49.27 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  47.42 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  40.55 
 
 		 296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  66.39 
 
 		 404 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  42.04 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  41.7 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  46.98 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  41.7 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  66.1 
 
 		 379 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  66.1 
 
 		 379 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  66.1 
 
 		 379 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  66.1 
 
 		 363 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  66.1 
 
 		 379 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  66.1 
 
 		 379 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  39.78 
 
 		 285 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.29 
 
 		 296 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  45.29 
 
 		 296 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  45.29 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  47.17 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.29 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.29 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.29 
 
 		 233 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  34.65 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  41.92 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  42.37 
 
 		 301 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  44.3 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  43.98 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  39.78 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  39.78 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  38.66 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  39.74 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  35.31 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  62.71 
 
 		 307 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  42.51 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  40.17 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  48.67 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  44.16 
 
 		 292 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  37.73 
 
 		 298 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  38.35 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  37.89 
 
 		 296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  40 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  41.03 
 
 		 307 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  39.91 
 
 		 296 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  37.21 
 
 		 298 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  43.06 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  41.59 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  41.67 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  46.15 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  44.24 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  42.92 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  39.3 
 
 		 296 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>