More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2351 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  91.43 
 
 		 315 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  74.61 
 
 		 312 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  73.08 
 
 		 295 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  71.15 
 
 		 296 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  73.08 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  71.79 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  71.79 
 
 		 296 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  71.47 
 
 		 292 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  69.97 
 
 		 298 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  69.77 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  68.59 
 
 		 294 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  69.77 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  69.77 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  69.77 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  69.77 
 
 		 296 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  69.38 
 
 		 292 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  66.67 
 
 		 292 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  57.41 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  54.67 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  53.66 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  47.59 
 
 		 304 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  53.74 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  48.37 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  50 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  49.66 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  47.56 
 
 		 298 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  49.28 
 
 		 275 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  48.71 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  48.16 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  51.85 
 
 		 317 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  51.47 
 
 		 268 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  48.87 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  46.52 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  50.41 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  50.61 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  49.19 
 
 		 238 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  43.49 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  43.71 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  48.78 
 
 		 240 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  47.15 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  47.15 
 
 		 233 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  47.15 
 
 		 233 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  47.15 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  47.15 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  47.15 
 
 		 233 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  47.15 
 
 		 233 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  49.59 
 
 		 230 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  46.59 
 
 		 236 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  44.44 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  45.23 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  41.44 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  43.46 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  38.81 
 
 		 257 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  45.87 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  40.34 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  40.46 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  42.76 
 
 		 262 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  42.39 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  40.2 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  49.59 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  49.18 
 
 		 233 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  49.18 
 
 		 233 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  43.09 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  44.13 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.15 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  42.15 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  41.55 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.8 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.15 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.15 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  48.77 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  40.34 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  44.58 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.66 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  40.77 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  46.72 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  39.06 
 
 		 289 aa  182  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  42.39 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  37.69 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  38.57 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  38.57 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  42.39 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  40.34 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  39.17 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  37.92 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  41.32 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  36.89 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  34.39 
 
 		 367 aa  175  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  38.74 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  42.02 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  43.78 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  41.15 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  39.19 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  39.19 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  37.66 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  41.56 
 
 		 248 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  39.62 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  37.18 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  39.26 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>