More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1990 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  89.13 
 
 
230 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  90.43 
 
 
230 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  88.84 
 
 
233 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  88.84 
 
 
233 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  88.84 
 
 
233 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  78.01 
 
 
296 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  78.01 
 
 
296 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  88.41 
 
 
233 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  77.97 
 
 
236 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  75.72 
 
 
295 aa  346  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  78.54 
 
 
233 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  78.54 
 
 
233 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  78.54 
 
 
233 aa  345  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  78.54 
 
 
233 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  67.92 
 
 
240 aa  325  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  69.83 
 
 
238 aa  316  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  71.01 
 
 
236 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  50 
 
 
296 aa  218  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  50.64 
 
 
299 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  49.78 
 
 
295 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  51.53 
 
 
298 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  50.88 
 
 
296 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  50.88 
 
 
296 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  50.22 
 
 
295 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  48.28 
 
 
318 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  49.55 
 
 
292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  49.36 
 
 
292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  48.88 
 
 
301 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  50 
 
 
294 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  47.48 
 
 
312 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  46.72 
 
 
315 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  46.25 
 
 
311 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  47.62 
 
 
292 aa  201  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  53.18 
 
 
292 aa  201  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  48.91 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  48.91 
 
 
292 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  48.91 
 
 
296 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  48.91 
 
 
296 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  48.91 
 
 
296 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  48.91 
 
 
296 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  48.91 
 
 
296 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  46.44 
 
 
303 aa  198  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  46.38 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.7 
 
 
304 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  46.53 
 
 
295 aa  194  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  48.65 
 
 
275 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  49.33 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  47.71 
 
 
270 aa  194  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.65 
 
 
287 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  44.44 
 
 
315 aa  191  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  46.34 
 
 
295 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  48.39 
 
 
274 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  49.78 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  49.78 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  49.78 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  50.47 
 
 
250 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  47.44 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  46.23 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  45.29 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  50.5 
 
 
248 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  45.41 
 
 
274 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  45.98 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  45.98 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  45.98 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  45.98 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  45.98 
 
 
251 aa  178  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  46.67 
 
 
279 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  44.74 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  45.71 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  44.74 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  40.93 
 
 
285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  44.74 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  45.76 
 
 
293 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  40 
 
 
289 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  43.27 
 
 
257 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  38.85 
 
 
307 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  44.29 
 
 
261 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  40.55 
 
 
249 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  45.79 
 
 
284 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  41.78 
 
 
290 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  44.34 
 
 
289 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  44.8 
 
 
289 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  44.8 
 
 
289 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  44.7 
 
 
286 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  46.73 
 
 
242 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  40.44 
 
 
297 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41 
 
 
322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  62.81 
 
 
303 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  44.08 
 
 
263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41 
 
 
322 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41 
 
 
322 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41 
 
 
322 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41 
 
 
322 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  41 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  41 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  37.7 
 
 
325 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  45.71 
 
 
262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  42.04 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>