More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1252 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  100 
 
 		 260 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  47.58 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  46.89 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  47.91 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  47.91 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  45.49 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  49.14 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  45.79 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  43.73 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  47.98 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  45.79 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  42.09 
 
 		 272 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  43.3 
 
 		 257 aa  198  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  44.49 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  47.28 
 
 		 307 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  40.57 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  39.53 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  42.38 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  38.46 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  40 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  38.93 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  38.38 
 
 		 298 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  38.93 
 
 		 298 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  41.26 
 
 		 304 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  38.93 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  37.5 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  42.69 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  38.18 
 
 		 296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  42.69 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  37.5 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  38.79 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  43.16 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  39.93 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  39.93 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  39.58 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  38.16 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  40.14 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  38.76 
 
 		 374 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  40.47 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  39.69 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  39.69 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  35.48 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  39.69 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  36.74 
 
 		 377 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  36.74 
 
 		 377 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  36.74 
 
 		 377 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  37.97 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  36.74 
 
 		 377 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  40.86 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  36.36 
 
 		 377 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  36.5 
 
 		 379 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  36.5 
 
 		 379 aa  168  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  36.5 
 
 		 363 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  36.5 
 
 		 379 aa  168  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  36.5 
 
 		 379 aa  168  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  36.5 
 
 		 379 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  36.5 
 
 		 379 aa  168  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  36.5 
 
 		 363 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  36.5 
 
 		 379 aa  168  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  38.26 
 
 		 328 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  40.77 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  36.81 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  37.09 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  38.35 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  33.43 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  59.5 
 
 		 404 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  41.52 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  53.28 
 
 		 401 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  54.43 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  40.79 
 
 		 274 aa  158  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1246  novel lipoprotein homolog NlpD  37.64 
 
 		 247 aa  158  9e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  38.06 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  38.67 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  37.61 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  39.09 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1246  novel lipoprotein homolog NlpD  37.64 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  40.08 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  37.74 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  38.55 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  38.55 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  35.1 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  38.55 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  37.65 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  37.65 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  37.65 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  40.89 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  37.65 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  41.48 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  42.26 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  34.55 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  36.21 
 
 		 299 aa  148  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  36.26 
 
 		 261 aa  148  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  36.72 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  37.65 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  56.2 
 
 		 367 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0661  peptidase M23B  35.4 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0851983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  40.74 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65030  hypothetical protein  41.95 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.195389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0690  hypothetical protein  35.55 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  40.74 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>