More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_65030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_65030  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.195389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5650  hypothetical protein  97.73 
 
 		 231 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  49.13 
 
 		 293 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  44.49 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  43.87 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  43.96 
 
 		 288 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  45.69 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  45.69 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  41.76 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  43.01 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  43.38 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  43.04 
 
 		 284 aa  190  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  46.5 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  45.34 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  45.15 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  45.15 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  45.15 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  45.15 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  45.15 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  44.12 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  44.12 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  44.12 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  45.04 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  45.04 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  45.04 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  42.67 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  41.05 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  38.64 
 
 		 272 aa  175  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  46.15 
 
 		 250 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  46.15 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  42.98 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  41.23 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  40.96 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  42.29 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  42.29 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  40.53 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  41.13 
 
 		 295 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  40 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  40.52 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  40.52 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  38.21 
 
 		 315 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  42.99 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  48.26 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  46.04 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  41.87 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  38.25 
 
 		 310 aa  165  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  41.1 
 
 		 301 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  37.23 
 
 		 283 aa  164  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  40.82 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  40 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  42.6 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.33 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  45.33 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  40.09 
 
 		 298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  40.09 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  40.09 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  40.09 
 
 		 292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  40.09 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  40.09 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  40.09 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.33 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.33 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  45.33 
 
 		 296 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  45.33 
 
 		 296 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  44.74 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  38.98 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  37.05 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  43.06 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  37.45 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  41.25 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  41.5 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  39.22 
 
 		 318 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  44.39 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  42.34 
 
 		 274 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  36.73 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  32.41 
 
 		 298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  38.17 
 
 		 265 aa  154  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  38.08 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  32.07 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  32.41 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  33.21 
 
 		 285 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  39.04 
 
 		 265 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  44 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  40.17 
 
 		 292 aa  151  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  32.07 
 
 		 298 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  38.62 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  54.62 
 
 		 312 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  41.29 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  39.47 
 
 		 274 aa  148  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  32.88 
 
 		 298 aa  148  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  39.47 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  33.21 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  36.47 
 
 		 379 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  36.47 
 
 		 379 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  36.47 
 
 		 379 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  38.81 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  36.47 
 
 		 363 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  36.47 
 
 		 379 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  36.47 
 
 		 379 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  32.99 
 
 		 296 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>