More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0423 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0423  putative lipoprotein NlpD  100 
 
 
254 aa  507  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.897746  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0825  peptidase  100 
 
 
343 aa  507  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2373  putative peptidase  99.61 
 
 
343 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1801  putative lipoprotein NlpD  99.6 
 
 
250 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2512  putative peptidase  99.6 
 
 
250 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0472  putative lipoprotein NlpD  99.6 
 
 
250 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0634  lipoprotein NlpD, putative  88.93 
 
 
281 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0768696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  71.95 
 
 
245 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  71.36 
 
 
244 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  71.36 
 
 
244 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  71.36 
 
 
244 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  70.91 
 
 
244 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  68.18 
 
 
243 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  67.73 
 
 
243 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  52.02 
 
 
248 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  47.81 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  47.26 
 
 
256 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  42.12 
 
 
297 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  45.89 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1663  putative lipoprotein  49.3 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.79194  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  40.53 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  40.44 
 
 
294 aa  151  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  40.43 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  40.43 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  40.81 
 
 
292 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  43.78 
 
 
230 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.69 
 
 
233 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  40.69 
 
 
233 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.69 
 
 
233 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.69 
 
 
233 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  40.69 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  40.69 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  44.28 
 
 
230 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  37.86 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  38.94 
 
 
295 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  40.1 
 
 
236 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  38.94 
 
 
295 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  38.7 
 
 
298 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  40 
 
 
296 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  40 
 
 
296 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  38.7 
 
 
292 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  40 
 
 
296 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  37.5 
 
 
292 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  40 
 
 
296 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  40 
 
 
296 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  37.74 
 
 
312 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  37.7 
 
 
315 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  37.7 
 
 
299 aa  142  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  42.44 
 
 
236 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  41.12 
 
 
268 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  41.58 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.82 
 
 
322 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  40 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  36.93 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  36.07 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  37.93 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  36.82 
 
 
315 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.82 
 
 
322 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.82 
 
 
322 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.98 
 
 
322 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  36.82 
 
 
322 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  37.98 
 
 
315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  40.45 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  40.1 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  36.33 
 
 
317 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  40.74 
 
 
275 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  38.57 
 
 
295 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  39.53 
 
 
274 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  37.75 
 
 
252 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  40.19 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  37.99 
 
 
287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  40.38 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  38.39 
 
 
240 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  37.92 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  36.97 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  39.44 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  37.92 
 
 
230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  37.74 
 
 
263 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  37.55 
 
 
292 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  36.76 
 
 
270 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1995  lipoprotein  40 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  36.56 
 
 
274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  40.18 
 
 
289 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  40.18 
 
 
289 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  34.35 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  33.91 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  39.29 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  36.86 
 
 
240 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  36.86 
 
 
293 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  39.61 
 
 
239 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  34.59 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  36.89 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  37.5 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  35.98 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  35.32 
 
 
261 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.81 
 
 
242 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  35.37 
 
 
295 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  37.14 
 
 
297 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  49.21 
 
 
384 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  32.32 
 
 
288 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>