More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1654 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1654  lipoprotein NlpD, putative  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  68.8 
 
 		 296 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  68.8 
 
 		 296 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  68.8 
 
 		 296 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  70.34 
 
 		 295 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  70.34 
 
 		 295 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  64.18 
 
 		 292 aa  184  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  70.34 
 
 		 294 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  62.22 
 
 		 315 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  62.5 
 
 		 312 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  65.32 
 
 		 311 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  69.49 
 
 		 298 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  66.4 
 
 		 292 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  69.49 
 
 		 296 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  69.49 
 
 		 292 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  69.49 
 
 		 296 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  69.49 
 
 		 296 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  69.49 
 
 		 296 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  69.49 
 
 		 296 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  52.17 
 
 		 284 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  57.72 
 
 		 233 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  57.72 
 
 		 233 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  57.72 
 
 		 233 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  57.72 
 
 		 233 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  53.79 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  57.72 
 
 		 296 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  57.72 
 
 		 296 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  56.91 
 
 		 236 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  57.89 
 
 		 317 aa  154  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  53.68 
 
 		 230 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  57.72 
 
 		 295 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  61.67 
 
 		 298 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  50 
 
 		 293 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  54.48 
 
 		 297 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  50.96 
 
 		 262 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  55.91 
 
 		 292 aa  150  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  55.12 
 
 		 238 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  50.96 
 
 		 262 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  57.5 
 
 		 315 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  59.17 
 
 		 303 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  55.83 
 
 		 301 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  59.17 
 
 		 303 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  55.04 
 
 		 333 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  60 
 
 		 299 aa  148  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  55.83 
 
 		 236 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  58.68 
 
 		 270 aa  148  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  58.33 
 
 		 292 aa  148  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  56.56 
 
 		 240 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  51.55 
 
 		 285 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  58.33 
 
 		 318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  58.33 
 
 		 295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  55.83 
 
 		 293 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  52.63 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  57.5 
 
 		 285 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  50.72 
 
 		 288 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  55.83 
 
 		 288 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1990  peptidase M23B  57.35 
 
 		 239 aa  142  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  57.98 
 
 		 274 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  44.86 
 
 		 304 aa  141  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  54.92 
 
 		 274 aa  141  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  50.83 
 
 		 283 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  62.5 
 
 		 307 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  45.51 
 
 		 275 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  47.59 
 
 		 290 aa  139  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  58.62 
 
 		 360 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  48.98 
 
 		 260 aa  138  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  47.26 
 
 		 304 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  41.01 
 
 		 310 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  45.16 
 
 		 327 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  48.59 
 
 		 296 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  56.41 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  45.16 
 
 		 327 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  51.97 
 
 		 268 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  56.41 
 
 		 230 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  54.17 
 
 		 295 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  45.16 
 
 		 327 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  51.15 
 
 		 265 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  51.64 
 
 		 367 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  49.28 
 
 		 261 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  44.83 
 
 		 298 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4460  peptidase M23B  54.23 
 
 		 233 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  53.28 
 
 		 287 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  48.09 
 
 		 484 aa  134  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1299  peptidase M23B  54.23 
 
 		 233 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.132462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0836  peptidase M23B  54.23 
 
 		 233 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0155509  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1317  peptidase M23B  54.23 
 
 		 233 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  53.33 
 
 		 311 aa  134  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2015  Peptidase M23  47.18 
 
 		 167 aa  134  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582616  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  52.54 
 
 		 307 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  50 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  51.24 
 
 		 325 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  48.82 
 
 		 345 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  49.61 
 
 		 344 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  51.24 
 
 		 329 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  48.06 
 
 		 328 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  49.28 
 
 		 261 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  49.62 
 
 		 298 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  49.62 
 
 		 298 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1451  lipoprotein NlpD, putative  49.59 
 
 		 384 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  45.26 
 
 		 285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>