More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1901 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  100 
 
 
323 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  40.12 
 
 
328 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  33.65 
 
 
453 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  35.87 
 
 
394 aa  168  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  32.83 
 
 
471 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  43.04 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  34.59 
 
 
484 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  43.91 
 
 
284 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  43.38 
 
 
246 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  42.79 
 
 
261 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  39.65 
 
 
262 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  35.86 
 
 
464 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  39.65 
 
 
262 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  55.12 
 
 
449 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  54.33 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  54.92 
 
 
474 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.69 
 
 
274 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  52.11 
 
 
465 aa  152  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  39.58 
 
 
285 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  56.59 
 
 
447 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  37.38 
 
 
297 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  39.64 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  40.73 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  39.57 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  36.96 
 
 
427 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  40.54 
 
 
292 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  37.83 
 
 
438 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  38.75 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  39.91 
 
 
265 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  40.42 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  39.33 
 
 
291 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  41.7 
 
 
264 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  37.7 
 
 
315 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  36.52 
 
 
427 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  54.55 
 
 
501 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  54.55 
 
 
537 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  37.5 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  39.13 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  37.6 
 
 
294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  54.92 
 
 
500 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  38.82 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  36.41 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  36.41 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  38.65 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  36.41 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  36.41 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  34.36 
 
 
530 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  36.41 
 
 
251 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  37.08 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  52.89 
 
 
455 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  34.42 
 
 
633 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  52.89 
 
 
451 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  53.72 
 
 
446 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  37.67 
 
 
284 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  35.32 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  36.71 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  38.84 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  34.65 
 
 
534 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  39.82 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  52.89 
 
 
494 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  37.78 
 
 
295 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  52.46 
 
 
417 aa  136  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  38.08 
 
 
307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  39.38 
 
 
296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  39.38 
 
 
296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  40.67 
 
 
230 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  30.98 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  37.12 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  37.12 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  33.97 
 
 
509 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  37.12 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  37.12 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  34.31 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  37.33 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  37.12 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  37.12 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  37.12 
 
 
292 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  34.08 
 
 
377 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  34.08 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  37.5 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  37.5 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  35.41 
 
 
251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  34.08 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  34.08 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  37.5 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  35.41 
 
 
251 aa  133  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  37.5 
 
 
250 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  35.41 
 
 
251 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  37.5 
 
 
250 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  37.12 
 
 
292 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  30.14 
 
 
602 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1246  novel lipoprotein homolog NlpD  39.9 
 
 
247 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  37.33 
 
 
270 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1246  novel lipoprotein homolog NlpD  39.42 
 
 
247 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  27.06 
 
 
509 aa  129  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  37.72 
 
 
274 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  35.32 
 
 
284 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  41.35 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  37.73 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  41.35 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>