More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1448 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  100 
 
 
509 aa  1013    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  26.82 
 
 
602 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  37.04 
 
 
530 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  31.09 
 
 
538 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  39.83 
 
 
427 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  36.1 
 
 
534 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  39.83 
 
 
427 aa  137  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  29.11 
 
 
412 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  39.21 
 
 
438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  30.67 
 
 
546 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  27.99 
 
 
323 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  29.37 
 
 
264 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  28.37 
 
 
353 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  35.5 
 
 
509 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  33.04 
 
 
394 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  33.33 
 
 
397 aa  121  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  34.1 
 
 
270 aa  120  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  33.94 
 
 
284 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  34.08 
 
 
265 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  33.18 
 
 
257 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  26.09 
 
 
733 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  30.9 
 
 
293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  33.63 
 
 
286 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  32.72 
 
 
279 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  34.56 
 
 
256 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  33.03 
 
 
279 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  28.14 
 
 
329 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  34.86 
 
 
261 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  32.74 
 
 
289 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  29.06 
 
 
297 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  32.74 
 
 
289 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  30.9 
 
 
292 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  28.33 
 
 
230 aa  111  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  31.56 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  35.32 
 
 
248 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  30.09 
 
 
285 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  32.75 
 
 
287 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2178  peptidase M23B  29.55 
 
 
244 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434952  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  27.92 
 
 
230 aa  110  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3804  peptidase M23  32.13 
 
 
243 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802385 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3288  peptidase M23B  31.45 
 
 
243 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  30.37 
 
 
244 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  35.76 
 
 
367 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  31.27 
 
 
309 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  29.74 
 
 
284 aa  110  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  29.77 
 
 
252 aa  109  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  26.04 
 
 
430 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  30.92 
 
 
310 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  30.77 
 
 
295 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  28.75 
 
 
409 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  30.18 
 
 
261 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  31.6 
 
 
292 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  29.84 
 
 
244 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  29.84 
 
 
244 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  29.84 
 
 
244 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  29.24 
 
 
296 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  33.63 
 
 
289 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  31.98 
 
 
230 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  29.44 
 
 
484 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  29.96 
 
 
294 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1300  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  30 
 
 
322 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  32.43 
 
 
261 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  38.24 
 
 
500 aa  107  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  30.97 
 
 
301 aa  107  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  32.49 
 
 
295 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1380  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  29.58 
 
 
322 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801957  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  32.13 
 
 
268 aa  106  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  28.94 
 
 
279 aa  106  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0661  peptidase M23B  27.73 
 
 
270 aa  106  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0851983  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  29.58 
 
 
322 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  30.04 
 
 
298 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2551  peptidase  30 
 
 
315 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  29.58 
 
 
322 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  28.39 
 
 
296 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  29.58 
 
 
322 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  31.02 
 
 
230 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  28.39 
 
 
296 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  29.58 
 
 
315 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  27.01 
 
 
596 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  41.13 
 
 
453 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  29.17 
 
 
661 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  30.89 
 
 
311 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  28.29 
 
 
325 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  30.97 
 
 
295 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  28.74 
 
 
291 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  41.18 
 
 
501 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  30.13 
 
 
262 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  31.2 
 
 
294 aa  104  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  30.13 
 
 
262 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  30.77 
 
 
275 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  27.48 
 
 
311 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  27.8 
 
 
324 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  41.88 
 
 
537 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4673  peptidase M23B  31.19 
 
 
245 aa  103  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241225  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  25.09 
 
 
283 aa  103  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  30.15 
 
 
301 aa  103  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  32.17 
 
 
299 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  40.32 
 
 
471 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  26.67 
 
 
297 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  30.37 
 
 
263 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>