More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0164 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  100 
 
 
353 aa  719    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  28.37 
 
 
509 aa  125  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  28.83 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  24.71 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  24.62 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  41.84 
 
 
465 aa  89.7  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  29.33 
 
 
602 aa  86.3  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  25.91 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0549  Peptidase M23  26.69 
 
 
261 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  28.16 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  26.74 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  27.22 
 
 
633 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  35.62 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  39.8 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  36.22 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  38.78 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  26.5 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  38.78 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  28.42 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  25.49 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  25.49 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  24.46 
 
 
530 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  38.78 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  39.13 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  39.13 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  41.84 
 
 
500 aa  79.7  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  38.24 
 
 
449 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  28.26 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  27.9 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  39.47 
 
 
417 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  35.61 
 
 
252 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  36 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  38.78 
 
 
484 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  35.59 
 
 
494 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  40.83 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  35.58 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  36.27 
 
 
471 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  36.72 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.28 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  36 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  27.6 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 
179 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  40.4 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  25.82 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.18 
 
 
797 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  36.3 
 
 
312 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  35.42 
 
 
261 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  40.82 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  22.67 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1654  lipoprotein NlpD, putative  41.84 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  38.66 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  40 
 
 
501 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  45.36 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  38.66 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  35.88 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  38.78 
 
 
537 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  36.8 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  32.87 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  28.79 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  31.18 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  38.38 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  36.64 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  34.93 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  28.18 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  37.19 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  37.5 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.19 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  35.9 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  37.5 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  37.5 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  37.5 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  37.19 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.19 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  37.5 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  38.61 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.19 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  37.5 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  37.62 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  37.04 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  37.82 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  36.89 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  37.82 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  23.42 
 
 
534 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  35.51 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  38.61 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  38.61 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  38.61 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  33.56 
 
 
477 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  38.61 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  35.77 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  30.36 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  37.62 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  40.82 
 
 
430 aa  72.8  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  29.43 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  23.59 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1921  peptidase M23  27.16 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  41 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  37.62 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  41 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  36.73 
 
 
538 aa  72.8  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>