More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1429 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  100 
 
 		 279 aa  567  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  35.09 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  34.35 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  36.26 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  36.26 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  36.26 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  36.26 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  36.26 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  33.33 
 
 		 374 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  34.81 
 
 		 377 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  32.96 
 
 		 377 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  32.96 
 
 		 377 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  32.96 
 
 		 377 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  35.89 
 
 		 264 aa  136  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  32.96 
 
 		 377 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  35.34 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  34.03 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  34.87 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  34.35 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  35.42 
 
 		 394 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  34.35 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  34.87 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  34.87 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  34.35 
 
 		 251 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  34.21 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  34.21 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  34.21 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  34.21 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  34.21 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  34.21 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  32.2 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  32.03 
 
 		 249 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  35.86 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  35.02 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  34.3 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  34.13 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  34.27 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  32.73 
 
 		 307 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  34.33 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  34.33 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  35.32 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  31.48 
 
 		 311 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  34.98 
 
 		 230 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  33.33 
 
 		 379 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  33.33 
 
 		 379 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  34.3 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  33.33 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  29.33 
 
 		 360 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  31.54 
 
 		 257 aa  122  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1246  novel lipoprotein homolog NlpD  35.17 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  33.58 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  28.08 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1246  novel lipoprotein homolog NlpD  35.17 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  31.33 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  32.09 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  29.75 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  33.21 
 
 		 328 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  32.65 
 
 		 427 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  34.98 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  32.65 
 
 		 427 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  33.58 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  33.74 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1428  peptidase M23B  30.83 
 
 		 245 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  28.08 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  33.72 
 
 		 309 aa  118  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  27.74 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  27.74 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  32.22 
 
 		 438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  30.8 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  33.74 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  30.71 
 
 		 464 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  29.37 
 
 		 298 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2507  lipoprotein  32.26 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  34.18 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  43.51 
 
 		 404 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  35.44 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  33.46 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  30.59 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  32.91 
 
 		 248 aa  115  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  33.74 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  33.88 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  31.75 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  32.5 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  30.68 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  32.97 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  30.83 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  30 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  30 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  32.11 
 
 		 530 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  33.89 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  32.8 
 
 		 265 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  30.96 
 
 		 534 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  32.91 
 
 		 484 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  28.73 
 
 		 412 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  33.05 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  32.53 
 
 		 315 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  32.51 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.51 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.51 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  33.19 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>