More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22030 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
409 aa  820    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.61 
 
 
546 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  28.63 
 
 
620 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.06 
 
 
327 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.27 
 
 
1001 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  27.5 
 
 
423 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  27.25 
 
 
602 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  26.64 
 
 
499 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  28.41 
 
 
509 aa  107  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  38.37 
 
 
307 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  25.71 
 
 
1021 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.47 
 
 
617 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32 
 
 
568 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.22 
 
 
612 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  29.22 
 
 
612 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.5 
 
 
797 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  31.5 
 
 
304 aa  97.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  36.17 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  31.53 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  31.87 
 
 
547 aa  93.6  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  26.96 
 
 
1079 aa  94  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
596 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  31.18 
 
 
179 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.58 
 
 
289 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.24 
 
 
470 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  29.17 
 
 
446 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  25.83 
 
 
661 aa  89.7  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  29.84 
 
 
514 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  33.52 
 
 
173 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  24.18 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 
517 aa  86.7  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  40.35 
 
 
255 aa  86.3  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  27.53 
 
 
539 aa  85.5  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  23.33 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  30.96 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  32.16 
 
 
733 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.22 
 
 
840 aa  84.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  41.6 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  32.98 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  34.43 
 
 
517 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  33.14 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  35.54 
 
 
301 aa  82  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  28.12 
 
 
515 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.57 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  32.57 
 
 
515 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  26.04 
 
 
556 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  29.21 
 
 
544 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 
503 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  36.11 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.1 
 
 
576 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  30.73 
 
 
527 aa  79.7  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  30.15 
 
 
515 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  25.46 
 
 
580 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  28.04 
 
 
519 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  27.84 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  30.68 
 
 
571 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
334 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 
334 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  30.81 
 
 
511 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  26.9 
 
 
552 aa  77  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  26.48 
 
 
553 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  24.87 
 
 
543 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  30.27 
 
 
518 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  30.53 
 
 
440 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  32.37 
 
 
548 aa  76.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  29.96 
 
 
495 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.14 
 
 
517 aa  76.3  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  29.08 
 
 
524 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  38.33 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  27.08 
 
 
515 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  27.08 
 
 
519 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  27.08 
 
 
515 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  29.76 
 
 
546 aa  74.3  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  26.05 
 
 
587 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.4 
 
 
679 aa  73.6  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  27.55 
 
 
515 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  29.35 
 
 
519 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  35 
 
 
265 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  27.81 
 
 
595 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.51 
 
 
527 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  33.62 
 
 
142 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  27.23 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.78 
 
 
581 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  25.6 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  26.56 
 
 
498 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  30.13 
 
 
1556 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.75 
 
 
515 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.4 
 
 
534 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  36.63 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  29.61 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  26.74 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  34.26 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  29.12 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  31.03 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  32.23 
 
 
465 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  27.68 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  35.24 
 
 
289 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  34.31 
 
 
285 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  38 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.09 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>