More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1583 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
142 aa  291  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  60.95 
 
 
307 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  47.17 
 
 
123 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  45.19 
 
 
335 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  43.7 
 
 
179 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  43.8 
 
 
173 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.69 
 
 
327 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  39.82 
 
 
341 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  42.06 
 
 
274 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.32 
 
 
470 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  36.79 
 
 
338 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  37.17 
 
 
277 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.67 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  39.25 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  33.07 
 
 
409 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.39 
 
 
255 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  33.03 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  40.22 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.02 
 
 
230 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  35.85 
 
 
419 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  35.19 
 
 
207 aa  67  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  35.85 
 
 
330 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  35.85 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.68 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  35.04 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  35.04 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  30.48 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  51.67 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  37.5 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  31.21 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  34.82 
 
 
620 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  30.91 
 
 
320 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  35.96 
 
 
390 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.6 
 
 
448 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  35.11 
 
 
430 aa  64.7  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  37.5 
 
 
267 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  34.82 
 
 
390 aa  64.3  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  34.92 
 
 
285 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  39.81 
 
 
423 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  36.79 
 
 
503 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  35.51 
 
 
546 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  27.46 
 
 
284 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  33.91 
 
 
264 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  46.03 
 
 
203 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.68 
 
 
797 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  29.75 
 
 
265 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  40 
 
 
290 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  29.51 
 
 
265 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.53 
 
 
612 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  31.53 
 
 
612 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 
423 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  28.93 
 
 
548 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  32.48 
 
 
266 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.76 
 
 
354 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  34.31 
 
 
265 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  29.51 
 
 
265 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  35.19 
 
 
395 aa  60.5  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  35.51 
 
 
466 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 
426 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5996  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.89 
 
 
270 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  31.13 
 
 
412 aa  60.1  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  39.6 
 
 
429 aa  60.1  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  29.51 
 
 
265 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  29.51 
 
 
265 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  29.51 
 
 
265 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 
368 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  29.51 
 
 
265 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  36.54 
 
 
420 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.41 
 
 
377 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  31.43 
 
 
353 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  32.2 
 
 
642 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  31.9 
 
 
399 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
733 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  28.69 
 
 
265 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  33.98 
 
 
287 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2242  Peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 
334 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  32.43 
 
 
544 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  34.91 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  34.62 
 
 
250 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  38.68 
 
 
271 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  27.87 
 
 
265 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  33.65 
 
 
446 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  30.19 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  38.68 
 
 
271 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  30.36 
 
 
467 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  31.86 
 
 
372 aa  55.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  27.87 
 
 
265 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  30.71 
 
 
389 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01740  expressed protein  31.25 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  46.43 
 
 
191 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  32.14 
 
 
547 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  47.83 
 
 
674 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.94 
 
 
391 aa  53.9  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 
709 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 
405 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 
444 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  44.68 
 
 
604 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  29.63 
 
 
1556 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  44.68 
 
 
613 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>