270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1754 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  89.29 
 
 
429 aa  807    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  100 
 
 
448 aa  914    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1628  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  31.23 
 
 
363 aa  96.3  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000128844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0632  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.23 
 
 
310 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0695  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.23 
 
 
310 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  46.79 
 
 
568 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  40.91 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  40.59 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  43.81 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  44.55 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0160  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  29.1 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000648956  unclonable  1.03661e-27 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  39.13 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
445 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  42.11 
 
 
320 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  39.6 
 
 
661 aa  71.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  39.05 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  37.89 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1135  phage lysin-like lysozyme M1  26.48 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36 
 
 
470 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  31.43 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  36.36 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  32.92 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  28.1 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  35.64 
 
 
250 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  38.6 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  41.28 
 
 
334 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  41.28 
 
 
334 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  39.39 
 
 
307 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  26.64 
 
 
1021 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.01 
 
 
954 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0538  muramidase (flagellum-specific)  39.25 
 
 
361 aa  64.3  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000149562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.94 
 
 
327 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  39.42 
 
 
301 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  39.6 
 
 
142 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  33 
 
 
633 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  35.79 
 
 
1556 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  39.18 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  37.61 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  34.65 
 
 
284 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  35.04 
 
 
522 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  39.45 
 
 
733 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  40.82 
 
 
267 aa  60.5  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  38.54 
 
 
1079 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  36.45 
 
 
255 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.5 
 
 
1001 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  30.1 
 
 
253 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  30.19 
 
 
287 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  37.11 
 
 
546 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  25.69 
 
 
256 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
444 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.63 
 
 
289 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.35 
 
 
335 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.34 
 
 
617 aa  57  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  31.63 
 
 
394 aa  57  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
368 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.36 
 
 
457 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  31.53 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  38.83 
 
 
495 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  37.11 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.36 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  40.82 
 
 
290 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  25.23 
 
 
301 aa  55.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  36.27 
 
 
112 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  33.05 
 
 
440 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2755  Peptidoglycan-binding LysM  33.91 
 
 
1147 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00369257  normal  0.0269725 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  32 
 
 
314 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  40.91 
 
 
285 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  31.58 
 
 
590 aa  53.9  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  34.26 
 
 
409 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.98 
 
 
797 aa  53.5  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  33.33 
 
 
395 aa  53.1  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  58.7 
 
 
184 aa  53.1  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  31.91 
 
 
596 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  35.35 
 
 
511 aa  53.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  33.64 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.67 
 
 
637 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.83 
 
 
593 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  32.29 
 
 
320 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.79 
 
 
406 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  34.45 
 
 
445 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  33.33 
 
 
303 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.83 
 
 
631 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  33.66 
 
 
515 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.79 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  40.51 
 
 
262 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  36.11 
 
 
466 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.79 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  40.51 
 
 
262 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  38.14 
 
 
289 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.79 
 
 
455 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  26.5 
 
 
509 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.79 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  35.35 
 
 
253 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  31.78 
 
 
544 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  53.49 
 
 
204 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  34.38 
 
 
323 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.51 
 
 
288 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  40.74 
 
 
304 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  58.14 
 
 
332 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>