More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0925 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
327 aa  647    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  40.48 
 
 
307 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  31.1 
 
 
409 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  32.89 
 
 
546 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.12 
 
 
470 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.24 
 
 
797 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  36.09 
 
 
173 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  31.67 
 
 
405 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  37.72 
 
 
304 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.89 
 
 
289 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  33.14 
 
 
620 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  35.2 
 
 
334 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  35.2 
 
 
334 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  45.69 
 
 
142 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 
440 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  33.14 
 
 
423 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 
445 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  35.75 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  25.66 
 
 
499 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  32.85 
 
 
568 aa  96.7  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1555  peptidoglycan-binding LysM  34.57 
 
 
399 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  31.98 
 
 
179 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  35.6 
 
 
446 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  31.95 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4066  Peptidoglycan-binding LysM  32.32 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  31.84 
 
 
544 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  38.89 
 
 
423 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.72 
 
 
391 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  25.86 
 
 
509 aa  89  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  33.33 
 
 
324 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  42.5 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  31.28 
 
 
547 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  32.18 
 
 
661 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  27.65 
 
 
539 aa  87  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.48 
 
 
433 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  32.11 
 
 
596 aa  85.9  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.56 
 
 
612 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 
612 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  31.09 
 
 
515 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  40.96 
 
 
733 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  30.21 
 
 
514 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  36.52 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  36.25 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  31.09 
 
 
515 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  29.32 
 
 
556 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  35.88 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  25.23 
 
 
1001 aa  82.4  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  30.57 
 
 
515 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  31.09 
 
 
515 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  30.81 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  34.65 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  31.64 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  25.15 
 
 
1021 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  28.92 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  48.96 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  41.24 
 
 
428 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  40.77 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  26.79 
 
 
617 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  33.87 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  40.71 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  28.08 
 
 
849 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  41.03 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  27.91 
 
 
695 aa  76.6  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  27.27 
 
 
587 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  39.78 
 
 
428 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  31.4 
 
 
414 aa  75.9  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  39.13 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  39.13 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  39.13 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  39.13 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  39.13 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  26.74 
 
 
539 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  39.13 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  38.06 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.28 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  38.04 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  38.04 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  38.04 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.84 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  30.43 
 
 
518 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  29.19 
 
 
642 aa  73.9  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  31.43 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  26.63 
 
 
602 aa  73.2  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  30.64 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  29.38 
 
 
527 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  41.67 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  30.11 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  27.65 
 
 
633 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  32 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  28.8 
 
 
554 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.59 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  31.21 
 
 
444 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  37.01 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  37.88 
 
 
503 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  35.96 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  27.46 
 
 
515 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  36.96 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  27.46 
 
 
519 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>