More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0223 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 
470 aa  960    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  42.16 
 
 
428 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  41.81 
 
 
428 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  45.79 
 
 
426 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  44.06 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  38.33 
 
 
430 aa  326  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  38.25 
 
 
430 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  38.25 
 
 
430 aa  323  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  38.68 
 
 
430 aa  322  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  38.68 
 
 
430 aa  322  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  38.25 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  38.25 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  37.61 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 
430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 
430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  37.35 
 
 
430 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  35.32 
 
 
423 aa  272  9e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  34.13 
 
 
420 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  35.2 
 
 
342 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  26.72 
 
 
503 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  29.97 
 
 
374 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  29.93 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  29.11 
 
 
426 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  32.3 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.78 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 
349 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  29.39 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  27.96 
 
 
358 aa  130  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  31.37 
 
 
384 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  33.74 
 
 
451 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  30.32 
 
 
793 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  29.14 
 
 
343 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.12 
 
 
327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  40.12 
 
 
307 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  29.96 
 
 
688 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.74 
 
 
1115 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  30.35 
 
 
356 aa  110  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  29.33 
 
 
647 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.46 
 
 
1115 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  29.21 
 
 
356 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.08 
 
 
1115 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  24.15 
 
 
1119 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 
418 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 
427 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  24.15 
 
 
1115 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  26 
 
 
484 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 
426 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  40.14 
 
 
304 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  32.07 
 
 
499 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.79 
 
 
405 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 
596 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  25.51 
 
 
415 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  26.44 
 
 
521 aa  91.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  29.24 
 
 
409 aa  91.3  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.46 
 
 
927 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  31.74 
 
 
287 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  31.82 
 
 
446 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  30.19 
 
 
173 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 
445 aa  87.8  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  21.59 
 
 
567 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 
1154 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.14 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  38.32 
 
 
142 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  26.67 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  37.2 
 
 
571 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  31.45 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.58 
 
 
576 aa  84  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.86 
 
 
797 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.3 
 
 
612 aa  83.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  34.3 
 
 
612 aa  83.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  31.18 
 
 
620 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  33.54 
 
 
314 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  34.16 
 
 
661 aa  83.2  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  38.96 
 
 
733 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  28.74 
 
 
554 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.9 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  40.91 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  29.34 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.98 
 
 
840 aa  80.1  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  23.64 
 
 
579 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  32.3 
 
 
337 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.55 
 
 
1124 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  30.63 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  26.59 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  22.92 
 
 
583 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  23.68 
 
 
542 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.53 
 
 
579 aa  77  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.36 
 
 
546 aa  77  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  33.53 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  28.57 
 
 
514 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  39.62 
 
 
284 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  25.74 
 
 
444 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  26.01 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  27.14 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  38.89 
 
 
503 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  28.81 
 
 
547 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  42.42 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  24.66 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  31.58 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>